More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0918 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 746 aa  1532    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  81.74 
 
 		 726 aa  1254    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  81.88 
 
 		 726 aa  1259    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  66.44 
 
 		 732 aa  1029    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  81.74 
 
 		 726 aa  1256    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  68.18 
 
 		 733 aa  1051    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  47.62 
 
 		 745 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  47.76 
 
 		 745 aa  704    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  47.92 
 
 		 764 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  47.13 
 
 		 742 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  48.16 
 
 		 745 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  69.79 
 
 		 732 aa  1075    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  44.04 
 
 		 723 aa  599  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  43.93 
 
 		 723 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 		 817 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 		 808 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 		 808 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 698 aa  466  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 758 aa  333  7.000000000000001e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 751 aa  324  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  30.12 
 
 		 813 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  30.18 
 
 		 816 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  31.41 
 
 		 755 aa  295  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 843 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 849 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  28.81 
 
 		 812 aa  263  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 839 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 738 aa  250  9e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 697 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 709 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  27.26 
 
 		 714 aa  207  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  27.89 
 
 		 713 aa  205  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 704 aa  204  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 701 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 718 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 721 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 725 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 723 aa  195  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 701 aa  195  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 725 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 725 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  26.98 
 
 		 717 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 725 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 710 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 716 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 723 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 716 aa  177  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  26.3 
 
 		 721 aa  175  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 723 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  24.23 
 
 		 771 aa  174  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 700 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  26.35 
 
 		 704 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 783 aa  160  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 739 aa  160  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 809 aa  157  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 		 724 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 728 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  25.29 
 
 		 713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 753 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  27.59 
 
 		 332 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 817 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  28.99 
 
 		 646 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 736 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 670 aa  82.4  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.41 
 
 		 661 aa  79  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.39 
 
 		 774 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  28.3 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  28.97 
 
 		 618 aa  75.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  32.81 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 626 aa  74.7  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 621 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.39 
 
 		 690 aa  74.3  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 634 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 648 aa  73.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 626 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 		 774 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.76 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 737 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  30.72 
 
 		 663 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 663 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  28.81 
 
 		 660 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  30.72 
 
 		 663 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 698 aa  72  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  28.81 
 
 		 660 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  30.72 
 
 		 663 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  30.72 
 
 		 663 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  30.72 
 
 		 659 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  30.72 
 
 		 663 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 762 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  29.46 
 
 		 676 aa  70.9  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.46 
 
 		 676 aa  70.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  29.46 
 
 		 676 aa  70.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 742 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 686 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 621 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>