43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0768 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  350  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  79.31 
 
 		 174 aa  278  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  79.31 
 
 		 174 aa  278  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  79.31 
 
 		 174 aa  278  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  71.26 
 
 		 175 aa  253  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  70.69 
 
 		 175 aa  249  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  61.18 
 
 		 174 aa  202  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  64.5 
 
 		 174 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  46.86 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  37.58 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  32.08 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  34.53 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1973  hypothetical protein  34.97 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004484  hypothetical protein  31.14 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000519516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  37.62 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  37.62 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  37.62 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  37.62 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  37.62 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00908  hypothetical protein  30.49 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  36.63 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0360  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000215067  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  35.64 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3798  hypothetical protein  33.1 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1154  hypothetical protein  30.6 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00206415  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4456  hypothetical protein  26 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  37.61 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  37.17 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  37.17 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  37.17 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0988  hypothetical protein  28.3 
 
 		 102 aa  52.4  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000290361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2655  hypothetical protein  36.25 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2525  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0238  hypothetical protein  31.33 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0647001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  29.05 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1959  hypothetical protein  32.53 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2000  protein of unknown function DUF721  30.16 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>