More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0736 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  74.95 
 
 		 536 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  74.58 
 
 		 536 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  74.58 
 
 		 536 aa  725    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  77.2 
 
 		 535 aa  778    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  74.95 
 
 		 536 aa  729    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  80.75 
 
 		 535 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  74.44 
 
 		 537 aa  657    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  74.58 
 
 		 536 aa  727    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  80.37 
 
 		 535 aa  834    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  73.6 
 
 		 536 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  74.58 
 
 		 536 aa  726    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  74.77 
 
 		 536 aa  730    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  74.58 
 
 		 536 aa  729    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  73.27 
 
 		 536 aa  733    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  73.6 
 
 		 536 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  80.56 
 
 		 535 aa  834    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  77.38 
 
 		 535 aa  783    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  74.39 
 
 		 536 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 535 aa  1046    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  73.27 
 
 		 536 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  73.6 
 
 		 536 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  74.95 
 
 		 536 aa  697    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  73.41 
 
 		 536 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  46.65 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  46.9 
 
 		 516 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  46.58 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  43.46 
 
 		 534 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  44.47 
 
 		 540 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  42.72 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  43.09 
 
 		 543 aa  353  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 		 509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  40.93 
 
 		 545 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  41.43 
 
 		 541 aa  317  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  42.23 
 
 		 531 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  41.61 
 
 		 555 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  39.23 
 
 		 521 aa  254  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  42.15 
 
 		 504 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  41.94 
 
 		 504 aa  250  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  40.44 
 
 		 523 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  41.58 
 
 		 504 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  40.13 
 
 		 542 aa  243  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 		 663 aa  120  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.13 
 
 		 550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 		 634 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.33 
 
 		 606 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.53 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.22 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.67 
 
 		 572 aa  99  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.28 
 
 		 515 aa  95.1  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 		 564 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  21 
 
 		 560 aa  92.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 		 597 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.6 
 
 		 318 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.89 
 
 		 288 aa  89.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.06 
 
 		 284 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 		 569 aa  88.2  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.12 
 
 		 532 aa  87.4  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.28 
 
 		 285 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5170  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.95 
 
 		 272 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451944  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0292  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.35 
 
 		 272 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.48873 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.96 
 
 		 285 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5230  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.95 
 
 		 272 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1449  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.42 
 
 		 281 aa  86.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.847792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0309  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.04 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5077  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.95 
 
 		 272 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.49 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 		 225 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0083  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.95 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.94 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2109  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.96 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1126  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.14 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.1 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2015  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.1 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2479  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.1 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.1 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.23 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.1 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.1 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.05 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 		 565 aa  84  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1862  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.62 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.04 
 
 		 277 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.7 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.43 
 
 		 276 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4740  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.58 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00816228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1122  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.58 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1602  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.58 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1579  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.58 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.67 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3692  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.5 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  25.55 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31730  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.24 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  25.55 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.97 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.16 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>