More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0711 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  33.48 
 
 		 232 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  35.51 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  35.51 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  35.51 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  34.42 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  37.76 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.51 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  35.51 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  35.51 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  35.51 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  35.51 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  35.51 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  35.51 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  35.51 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  33.33 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  32.41 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  35.59 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  31.94 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  39.01 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  33.49 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  33.69 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  31.06 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  34.26 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  33.77 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3766  GntR domain protein  34.4 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3478  GntR domain protein  34.84 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.554366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  36.74 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5704  GntR domain protein  37.56 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  32.3 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  35.65 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  35.16 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  35.59 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  34.29 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  29.55 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  35.61 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1146  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  29.77 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0940  GntR domain protein  28.38 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  31.91 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  29.82 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  35.35 
 
 		 287 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  34.65 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.11 
 
 		 238 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.24 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  27.87 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  27.87 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>