183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0586 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  100 
 
 		 358 aa  724    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01409  hypothetical protein  72.62 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2194  putative receptor  72.62 
 
 		 353 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000873978  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1724  hypothetical protein  72.62 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2058  hypothetical protein  72.62 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132417  hitchhiker  0.00041859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1539  hypothetical protein  72.31 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1634  hypothetical protein  72.62 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.679597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01420  hypothetical protein  72.62 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2207  putative receptor  72.62 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0362062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1719  hypothetical protein  72.31 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1701  hypothetical protein  72.27 
 
 		 353 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.117434  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1574  putative periplasmic protein  72.27 
 
 		 353 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000189121  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1704  hypothetical protein  71.96 
 
 		 353 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188458  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1765  hypothetical protein  71.96 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1755  hypothetical protein  71.96 
 
 		 353 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0322938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2098  hypothetical protein  71.65 
 
 		 353 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3495  putative receptor  40.11 
 
 		 356 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1057  putative periplasmic protein  41.59 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00889034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1100  putative receptor  37.43 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0381  hypothetical protein  35.84 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.71003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  31.69 
 
 		 384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0979  hypothetical protein  27.97 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0114  hypothetical protein  26.3 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.715385  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  30.74 
 
 		 1094 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  26.32 
 
 		 451 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.2 
 
 		 752 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.24 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1667 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.35 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1940  hypothetical protein  24.5 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.86 
 
 		 601 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.82 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.11 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.16 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  26.99 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.78 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1880  hypothetical protein  25.89 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.47 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.33 
 
 		 810 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.15 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  24.03 
 
 		 819 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  27.88 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0625  hypothetical protein  28.4 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  26.49 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  26.49 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.83 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.58 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.32 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1189 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  28.48 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3472  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.83 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.61 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.61 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.72 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.14 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  26.81 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.57 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  25.54 
 
 		 971 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.84 
 
 		 829 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.74 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 154 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.31 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  34.78 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.46 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.61 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.75 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  28.25 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  28.25 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  25.52 
 
 		 660 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.6 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.31 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.67 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.63 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.01 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.01 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.56 
 
 		 689 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.99 
 
 		 660 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6515  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.44 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.761865  normal  0.0861969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.61 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  23.89 
 
 		 580 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.41 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.76 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.63 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.86 
 
 		 327 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.47 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.58 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.82 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.75 
 
 		 607 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.71 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.71 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  34.07 
 
 		 556 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.41 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.71 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  22.54 
 
 		 1189 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.67 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>