282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0573 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  100 
 
 
491 aa  1018    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  73.5 
 
 
474 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  68.75 
 
 
472 aa  631  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  68.53 
 
 
472 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  68.53 
 
 
472 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  68.53 
 
 
472 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  68.3 
 
 
472 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  68.53 
 
 
472 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  68.3 
 
 
472 aa  630  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  67.56 
 
 
471 aa  619  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  66.3 
 
 
476 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  66.08 
 
 
476 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  66.08 
 
 
476 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  66.08 
 
 
476 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  65.85 
 
 
476 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  65.33 
 
 
447 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  49.33 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  53.05 
 
 
417 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  48.42 
 
 
426 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  49.66 
 
 
417 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.42 
 
 
418 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  49.07 
 
 
419 aa  379  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  48.39 
 
 
428 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  50.61 
 
 
406 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  47.45 
 
 
425 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  50.86 
 
 
424 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  50.56 
 
 
415 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  47.52 
 
 
487 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  49.2 
 
 
323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.78 
 
 
328 aa  243  7.999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  42.31 
 
 
305 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  38.57 
 
 
417 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  39.06 
 
 
416 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  42.04 
 
 
416 aa  226  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  38.1 
 
 
417 aa  210  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  35.75 
 
 
338 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  37.33 
 
 
329 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  36.22 
 
 
327 aa  187  4e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  34.2 
 
 
324 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  36.11 
 
 
373 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  34.85 
 
 
727 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  33.69 
 
 
320 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  34.85 
 
 
331 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  35.01 
 
 
657 aa  159  9e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
318 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  32.63 
 
 
311 aa  154  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  39.77 
 
 
438 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  31.05 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32.23 
 
 
319 aa  139  1e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  30.61 
 
 
350 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  39.71 
 
 
467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  31.78 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
350 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.81 
 
 
451 aa  127  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  39.3 
 
 
437 aa  126  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.22 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
368 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.68 
 
 
313 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  33.48 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  27.63 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  33.48 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  35.68 
 
 
423 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
413 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  35.21 
 
 
423 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  27.72 
 
 
352 aa  106  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
456 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
456 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 
444 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.68 
 
 
348 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.33 
 
 
435 aa  97.4  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  25.83 
 
 
400 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  30.16 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 
490 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 
334 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  27.02 
 
 
335 aa  89.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  31.71 
 
 
483 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  26 
 
 
389 aa  87.8  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
411 aa  87  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
310 aa  87  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  30.49 
 
 
239 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  26.23 
 
 
386 aa  87  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.79 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.63 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  25.85 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  32.5 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  28.14 
 
 
315 aa  82  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0125  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.36 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  26.91 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  23.3 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
671 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0056  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  48.51 
 
 
88 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>