More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0554 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0554  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
339 aa  708    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.270537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0425  ornithine carbamoyltransferase subunit I  83.83 
 
 
335 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0374  ornithine carbamoyltransferase subunit I  83.83 
 
 
335 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3732  ornithine carbamoyltransferase subunit I  81.25 
 
 
338 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3566  ornithine carbamoyltransferase subunit I  80.78 
 
 
339 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4042  ornithine carbamoyltransferase subunit I  80.54 
 
 
335 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3549  ornithine carbamoyltransferase subunit I  80.84 
 
 
335 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3684  ornithine carbamoyltransferase subunit I  80.54 
 
 
335 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0459  ornithine carbamoyltransferase subunit F  78.74 
 
 
334 aa  564  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0130179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04120  ornithine carbamoyltransferase 1  77.54 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4734  ornithine carbamoyltransferase subunit I  77.54 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488433  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4510  ornithine carbamoyltransferase subunit I  77.54 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0746684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5775  ornithine carbamoyltransferase subunit I  77.84 
 
 
334 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4825  ornithine carbamoyltransferase subunit I  77.84 
 
 
337 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3758  ornithine carbamoyltransferase subunit I  77.54 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04084  hypothetical protein  77.54 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3332  ornithine carbamoyltransferase  77.84 
 
 
334 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3743  ornithine carbamoyltransferase  77.25 
 
 
334 aa  559  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4829  ornithine carbamoyltransferase subunit I  76.95 
 
 
334 aa  558  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4853  ornithine carbamoyltransferase subunit I  76.65 
 
 
334 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458759  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4817  ornithine carbamoyltransferase subunit I  76.35 
 
 
334 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4724  ornithine carbamoyltransferase subunit I  76.65 
 
 
334 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4872  ornithine carbamoyltransferase subunit I  76.65 
 
 
334 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4754  ornithine carbamoyltransferase subunit I  76.65 
 
 
334 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2091  ornithine carbamoyltransferase  73.48 
 
 
334 aa  518  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.63428  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002420  ornithine carbamoyltransferase  71.17 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0450  ornithine carbamoyltransferase  69.82 
 
 
334 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.601732  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03645  ornithine carbamoyltransferase  70.25 
 
 
334 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0520  ornithine carbamoyltransferase  69.51 
 
 
334 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4811  ornithine carbamoyltransferase  68.69 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.278589  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4748  ornithine carbamoyltransferase  68.69 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4867  ornithine carbamoyltransferase  68.69 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4847  ornithine carbamoyltransferase  68.39 
 
 
334 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5912  ornithine carbamoyltransferase  62.65 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0747  ornithine carbamoyltransferase  62.92 
 
 
333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0828856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68340  ornithine carbamoyltransferase  63.14 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.170592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1107  ornithine carbamoyltransferase  62.95 
 
 
336 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7762  normal  0.256568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2799  ornithine carbamoyltransferase  64.74 
 
 
334 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1000  ornithine carbamoyltransferase  62.05 
 
 
336 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4224  ornithine carbamoyltransferase  61.75 
 
 
336 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1992  ornithine carbamoyltransferase  64.33 
 
 
334 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4387  ornithine carbamoyltransferase  62.05 
 
 
336 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0999  ornithine carbamoyltransferase  62.05 
 
 
336 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4647  ornithine carbamoyltransferase  64.11 
 
 
333 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1037  ornithine carbamoyltransferase  62.05 
 
 
336 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2126  ornithine carbamoyltransferase  63.11 
 
 
332 aa  431  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2685  ornithine carbamoyltransferase  61.52 
 
 
336 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.841413  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2240  ornithine carbamoyltransferase  62.92 
 
 
333 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1146  ornithine carbamoyltransferase  60.3 
 
 
336 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0914  ornithine carbamoyltransferase  60.3 
 
 
336 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12594  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2127  ornithine carbamoyltransferase  60.3 
 
 
336 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2385  ornithine carbamoyltransferase  60.61 
 
 
336 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0499309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1986  ornithine carbamoyltransferase  60.3 
 
 
336 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.370878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1586  ornithine carbamoyltransferase  60.3 
 
 
336 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0245  ornithine carbamoyltransferase  60.3 
 
 
336 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380448  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2351  ornithine carbamoyltransferase  61.89 
 
 
333 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0433  ornithine carbamoyltransferase  63 
 
 
333 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.776106  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1967  ornithine carbamoyltransferase  60.3 
 
 
336 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604049  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6442  ornithine carbamoyltransferase  60.91 
 
 
336 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.316397  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1976  ornithine carbamoyltransferase  60.43 
 
 
332 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5203  ornithine carbamoyltransferase  58.84 
 
 
334 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1252  ornithine carbamoyltransferase  61.59 
 
 
333 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1227  ornithine carbamoyltransferase  61.59 
 
 
333 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.149639  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1676  ornithine carbamoyltransferase  59.4 
 
 
339 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4538  ornithine carbamoyltransferase  59.88 
 
 
336 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0837196  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1908  ornithine carbamoyltransferase  63.55 
 
 
331 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000351047  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0090  ornithine carbamoyltransferase, catabolic  59.51 
 
 
331 aa  412  1e-114  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0425  ornithine carbamoyltransferase  60.67 
 
 
335 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1876  ornithine carbamoyltransferase  59.45 
 
 
332 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5576  ornithine carbamoyltransferase  59.09 
 
 
332 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2425  ornithine carbamoyltransferase  59.15 
 
 
334 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1390  ornithine carbamoyltransferase  59.88 
 
 
334 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00030197  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2176  ornithine carbamoyltransferase  58.84 
 
 
332 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06660  ornithine carbamoyltransferase  58.23 
 
 
331 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000120015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0929  ornithine carbamoyltransferase  58.59 
 
 
338 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142101  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0068  ornithine carbamoyltransferase  57.98 
 
 
329 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0182  ornithine carbamoyltransferase  55.52 
 
 
330 aa  382  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0342  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 
332 aa  378  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0872  ornithine carbamoyltransferase  55.21 
 
 
327 aa  379  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00322562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0473  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 
332 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0421  ornithine carbamoyltransferase  57.36 
 
 
332 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0408  ornithine carbamoyltransferase  57.36 
 
 
332 aa  374  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.297743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02370  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 
331 aa  371  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00840  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 
331 aa  371  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.96498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0349  ornithine carbamoyltransferase  56.1 
 
 
332 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4897  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 
332 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0162  ornithine carbamoyltransferase  54.77 
 
 
331 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0158  ornithine carbamoyltransferase  54.77 
 
 
331 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06550  ornithine carbamoyltransferase  52.91 
 
 
331 aa  357  9.999999999999999e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  0.675152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1948  ornithine carbamoyltransferase  53.78 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0387191  normal  0.307808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  53.66 
 
 
312 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2165  ornithine carbamoyltransferase  53.5 
 
 
337 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0031  ornithine carbamoyltransferase  51.98 
 
 
334 aa  348  7e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2658  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 
336 aa  348  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2714  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 
336 aa  348  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1457  ornithine carbamoyltransferase  50.15 
 
 
338 aa  335  9e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2249  ornithine carbamoyltransferase  50.31 
 
 
335 aa  333  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2321  ornithine carbamoyltransferase  49.1 
 
 
354 aa  329  4e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0930  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 
317 aa  329  4e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000010052  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0649  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
326 aa  318  6e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0046026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>