More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0421 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  68.78 
 
 		 1107 aa  1507    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  68.78 
 
 		 1107 aa  1507    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  69.14 
 
 		 1108 aa  1495    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  70.55 
 
 		 1107 aa  1558    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3811  hypothetical protein  75.77 
 
 		 1113 aa  1624    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.408276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  70.8 
 
 		 1107 aa  1547    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  68.81 
 
 		 1104 aa  1504    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0711  hypothetical protein  75.59 
 
 		 1113 aa  1621    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.871081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  69.14 
 
 		 1108 aa  1495    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  71.27 
 
 		 1107 aa  1565    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  68.87 
 
 		 1107 aa  1507    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  68.69 
 
 		 1107 aa  1504    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  68.78 
 
 		 1107 aa  1506    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  68.87 
 
 		 1107 aa  1508    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  68.87 
 
 		 1107 aa  1509    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 1115 aa  2260    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  69.14 
 
 		 1108 aa  1495    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  69.14 
 
 		 1108 aa  1495    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  69.14 
 
 		 1108 aa  1495    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  68.78 
 
 		 1107 aa  1507    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3664  hypothetical protein  75.77 
 
 		 1113 aa  1624    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.907056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  68.78 
 
 		 1107 aa  1507    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  70.66 
 
 		 1103 aa  1520    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  36.94 
 
 		 1080 aa  571  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 1078 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  38.03 
 
 		 1067 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  35.52 
 
 		 1070 aa  538  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 		 1067 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  38.13 
 
 		 1067 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  36.09 
 
 		 1067 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  35.15 
 
 		 1072 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  35.15 
 
 		 1072 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 1072 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 1067 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  35.24 
 
 		 1066 aa  525  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 1068 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 1060 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 1062 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  29.04 
 
 		 1117 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 1158 aa  369  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  29.19 
 
 		 1111 aa  365  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  28.51 
 
 		 1102 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  29.23 
 
 		 1102 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  28.87 
 
 		 1102 aa  357  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  28.21 
 
 		 1102 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  28.24 
 
 		 1134 aa  349  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  27.97 
 
 		 1120 aa  346  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  27.97 
 
 		 1120 aa  346  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  27.97 
 
 		 1120 aa  346  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  28.21 
 
 		 1134 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 861 aa  340  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 1110 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  28.41 
 
 		 1118 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 1127 aa  335  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  28.76 
 
 		 1120 aa  331  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 1120 aa  331  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  28.76 
 
 		 1120 aa  331  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  28.76 
 
 		 1120 aa  331  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1120 aa  331  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  28.94 
 
 		 1120 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  27.9 
 
 		 1133 aa  331  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  28.94 
 
 		 1118 aa  331  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  28.21 
 
 		 1118 aa  330  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  28.94 
 
 		 1120 aa  330  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  28.79 
 
 		 1120 aa  330  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  29.19 
 
 		 1115 aa  330  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.92 
 
 		 1144 aa  324  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 1166 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  30.01 
 
 		 1118 aa  321  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  30.01 
 
 		 1118 aa  320  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  30.01 
 
 		 1120 aa  320  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  30.01 
 
 		 1120 aa  320  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  30.01 
 
 		 1118 aa  320  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  28.31 
 
 		 1128 aa  318  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  29.16 
 
 		 1130 aa  311  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  26.39 
 
 		 1098 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  29.94 
 
 		 1110 aa  296  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 1105 aa  287  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 1235 aa  281  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  39.85 
 
 		 1117 aa  278  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.54 
 
 		 806 aa  162  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 860 aa  153  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 843 aa  151  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  36.14 
 
 		 299 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 840 aa  148  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 840 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 835 aa  147  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 799 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 832 aa  146  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  36.92 
 
 		 815 aa  145  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 803 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 		 853 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 796 aa  142  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 877 aa  141  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 855 aa  141  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 844 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 803 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 830 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 856 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  33.2 
 
 		 807 aa  138  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>