142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0407 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  69.32 
 
 		 195 aa  228  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  69.32 
 
 		 195 aa  228  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  67.4 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  68.94 
 
 		 166 aa  207  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  74.85 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  68.1 
 
 		 157 aa  203  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  74.23 
 
 		 157 aa  195  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  65.19 
 
 		 158 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  65.19 
 
 		 158 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  65.19 
 
 		 158 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  65.19 
 
 		 158 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  65.19 
 
 		 158 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  65.19 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  65.19 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  65.19 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  65.19 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  65.19 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  65.19 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  65.19 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0327  FxsA  64.33 
 
 		 157 aa  157  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4609  FxsA  68.79 
 
 		 158 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432194  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.1 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.85 
 
 		 195 aa  120  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  44.65 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  35.14 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.97 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.97 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.97 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.97 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.24 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  41.25 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  40.11 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  39.55 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.21 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.1 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.56 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.91 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.46 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.91 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  51.22 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.15 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.62 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  36.13 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.89 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.76 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.38 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.77 
 
 		 158 aa  85.1  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.55 
 
 		 161 aa  84.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  31.91 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.96 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  31.21 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.89 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.19 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.28 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  37.4 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.85 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.84 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.69 
 
 		 132 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  41.3 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  33.63 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.55 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  42 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.54 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  37.62 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  37.62 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  37.62 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.25 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  37.62 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.86 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  35.65 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.34 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  43 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  36.45 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  36.63 
 
 		 129 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  41.49 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  41.49 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.14 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.58 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  35.65 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  30.83 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  35.65 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  37.21 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.24 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  39.39 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.03 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  35.64 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.08 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.06 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0670  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.7 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  35.71 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  34.23 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  31.43 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.34 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.69 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2261  FxsA  38.53 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0672  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.63 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>