96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0294 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 
1967 aa  4076    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  43.61 
 
 
466 aa  346  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  42.68 
 
 
396 aa  319  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  38.07 
 
 
412 aa  250  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  35.14 
 
 
474 aa  225  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  33.98 
 
 
450 aa  224  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  31.94 
 
 
560 aa  206  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  32.02 
 
 
427 aa  206  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  31.55 
 
 
929 aa  202  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  32.04 
 
 
525 aa  200  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  31.78 
 
 
444 aa  201  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  31.84 
 
 
443 aa  200  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  30.94 
 
 
534 aa  199  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  31.37 
 
 
561 aa  199  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  31.93 
 
 
444 aa  198  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  31.4 
 
 
505 aa  197  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  30.79 
 
 
423 aa  194  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  31.75 
 
 
503 aa  190  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  31.07 
 
 
432 aa  179  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  30.07 
 
 
437 aa  172  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  30.41 
 
 
439 aa  171  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  28.18 
 
 
733 aa  164  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  25.45 
 
 
459 aa  153  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  27.21 
 
 
556 aa  144  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  28.07 
 
 
420 aa  143  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  27.23 
 
 
457 aa  142  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  25.77 
 
 
457 aa  139  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  27.65 
 
 
424 aa  137  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  25.93 
 
 
441 aa  135  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  25.51 
 
 
432 aa  134  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  25.93 
 
 
555 aa  128  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  22.95 
 
 
460 aa  115  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  24.65 
 
 
429 aa  112  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.03 
 
 
558 aa  91.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  33.17 
 
 
416 aa  89.4  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  30.13 
 
 
350 aa  84  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  31.5 
 
 
413 aa  84  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.56 
 
 
307 aa  82.8  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  29.85 
 
 
932 aa  80.1  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  30.41 
 
 
394 aa  79.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.59 
 
 
698 aa  79.7  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  34.26 
 
 
750 aa  77.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.41 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.34 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.2 
 
 
489 aa  70.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  24.78 
 
 
569 aa  70.1  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.41 
 
 
478 aa  67.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  26.19 
 
 
531 aa  65.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.7 
 
 
433 aa  63.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.67 
 
 
280 aa  62.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.37 
 
 
687 aa  60.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.2 
 
 
574 aa  59.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  27.69 
 
 
690 aa  59.3  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  27.05 
 
 
704 aa  58.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  29.91 
 
 
460 aa  57.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.18 
 
 
262 aa  57  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.2 
 
 
415 aa  56.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.05 
 
 
688 aa  55.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.12 
 
 
709 aa  55.5  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  26.52 
 
 
471 aa  54.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.8 
 
 
499 aa  54.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.9 
 
 
687 aa  54.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  28.97 
 
 
460 aa  54.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4324  coagulation factor 5/8 type, C-terminal  31.15 
 
 
223 aa  53.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.010102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  25.71 
 
 
581 aa  54.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.43 
 
 
487 aa  52.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.04 
 
 
467 aa  51.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.96 
 
 
437 aa  51.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.65 
 
 
499 aa  51.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  24.5 
 
 
1310 aa  51.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.89 
 
 
456 aa  50.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.64 
 
 
414 aa  50.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  22.06 
 
 
417 aa  50.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.56 
 
 
1212 aa  50.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.46 
 
 
704 aa  49.7  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  24.32 
 
 
507 aa  49.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  24.32 
 
 
507 aa  49.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.37 
 
 
971 aa  48.9  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  22.55 
 
 
261 aa  48.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.37 
 
 
437 aa  48.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
603 aa  48.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  26.63 
 
 
4761 aa  48.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  32.29 
 
 
463 aa  48.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.5 
 
 
289 aa  47  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.54 
 
 
431 aa  47.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.78 
 
 
496 aa  47  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.94 
 
 
519 aa  47  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.97 
 
 
639 aa  46.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  24.54 
 
 
678 aa  46.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.13 
 
 
431 aa  45.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  29.65 
 
 
430 aa  46.2  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.78 
 
 
1321 aa  45.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  32.54 
 
 
1588 aa  45.8  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  30.85 
 
 
676 aa  45.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.94 
 
 
437 aa  45.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.94 
 
 
437 aa  45.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>