More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0260 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  84.5 
 
 		 387 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  84.5 
 
 		 387 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  87.86 
 
 		 387 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  87.86 
 
 		 387 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  85.01 
 
 		 387 aa  688    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  85.01 
 
 		 387 aa  687    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  85.01 
 
 		 387 aa  691    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.5 
 
 		 387 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.5 
 
 		 387 aa  684    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  85.01 
 
 		 387 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  83.72 
 
 		 387 aa  683    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  84.5 
 
 		 387 aa  685    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.84 
 
 		 387 aa  651    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  83.98 
 
 		 387 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  85.53 
 
 		 387 aa  692    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.24 
 
 		 387 aa  685    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.5 
 
 		 387 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.5 
 
 		 387 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.5 
 
 		 387 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.75 
 
 		 387 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  87.86 
 
 		 387 aa  704    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 		 387 aa  790    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.2 
 
 		 387 aa  628  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.26 
 
 		 387 aa  627  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.53 
 
 		 387 aa  624  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.65 
 
 		 387 aa  614  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.34 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.09 
 
 		 387 aa  608  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.61 
 
 		 387 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.97 
 
 		 387 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.42 
 
 		 387 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.35 
 
 		 387 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.68 
 
 		 387 aa  596  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.21 
 
 		 374 aa  593  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.06 
 
 		 387 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.03 
 
 		 386 aa  569  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.03 
 
 		 386 aa  559  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.49 
 
 		 391 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.49 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.71 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.29 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.71 
 
 		 391 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.71 
 
 		 391 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.94 
 
 		 391 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.94 
 
 		 391 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.94 
 
 		 391 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.94 
 
 		 391 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.27 
 
 		 391 aa  511  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.38 
 
 		 391 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.8 
 
 		 390 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.73 
 
 		 390 aa  495  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.47 
 
 		 390 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.94 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.6 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.86 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  47.34 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  48.5 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.65 
 
 		 402 aa  342  7e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 398 aa  342  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  47.39 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.42 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  48.52 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.39 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  48.26 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.45 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.72 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.42 
 
 		 401 aa  328  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.42 
 
 		 401 aa  328  7e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.42 
 
 		 401 aa  328  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.42 
 
 		 401 aa  328  9e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  46.37 
 
 		 384 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.79 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  47.13 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  46.33 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  46.08 
 
 		 390 aa  322  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.34 
 
 		 424 aa  322  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.94 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  46.08 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  43.86 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  47.51 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.07 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  44.92 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.06 
 
 		 404 aa  319  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 		 398 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  45.94 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  48.17 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  45.94 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>