More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0233 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  77.27 
 
 		 396 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 395 aa  812    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  76.46 
 
 		 394 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  76.77 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  74.94 
 
 		 394 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  53.71 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  42.75 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  42.16 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 398 aa  329  7e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 395 aa  325  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  41.22 
 
 		 395 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 414 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  42.49 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  42.49 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  41.88 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  41.22 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  43.08 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 398 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  42.3 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  41.9 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 395 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  41.22 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  41.62 
 
 		 424 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  40.97 
 
 		 410 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  40.58 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.83 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  40.94 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  40.41 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 400 aa  269  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  39.07 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.38 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.81 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  40.26 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  40.26 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 463 aa  263  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  40.26 
 
 		 408 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.3 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  39.23 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.82 
 
 		 398 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.79 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.79 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  37.92 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.72 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  40.05 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  36.62 
 
 		 404 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  36.01 
 
 		 401 aa  255  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 450 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  35.22 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.55 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 396 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  39.12 
 
 		 421 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.62 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  33.93 
 
 		 446 aa  252  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  39.23 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  39.23 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  39.23 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  39.23 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  39.23 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  39.23 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  36.97 
 
 		 406 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 416 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  35.43 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 438 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 435 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.19 
 
 		 416 aa  246  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>