51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0201 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 424 aa  844    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0228  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  67.77 
 
 		 424 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0566  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  67.62 
 
 		 424 aa  521  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3990  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  67.38 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.523748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3956  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  57.69 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0249  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  55.77 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.084897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  58.75 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4147  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  56.97 
 
 		 420 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2806  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  51.56 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.639346 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1417  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  52.28 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02168  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  52.04 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2624  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  52.04 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1409  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  52.28 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02127  hypothetical protein  52.04 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2383  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  52.04 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2540  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  52.28 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3379  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  51.56 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2394  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  52.28 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2525  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2629  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.469709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2421  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  42.92 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.171516  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0396  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.82 
 
 		 452 aa  309  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0687  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.44 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1020  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  39.72 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  32.2 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0070  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.68 
 
 		 412 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1437  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.59 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4112  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.4 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.889687  normal  0.0200545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3389  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.71 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2843  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.73 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580036  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2101  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.51 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2517  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  30.8 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3300  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.71 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1520  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.1 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0570391  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3498  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  30.9 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1124  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  30.66 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1229  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.75 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  29.33 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1318  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.34 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2531  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  30.65 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1420  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.11 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1337  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.28 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.766172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4531  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 302 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.027558  normal  0.960138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  32.61 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1191  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 205 aa  43.5  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.015621  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1971  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.14 
 
 		 449 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  28.49 
 
 		 612 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>