14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0135 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  47.37 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  47.87 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  42.7 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  43.3 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  43.75 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  40.85 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  40.85 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  40.82 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  44.44 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  34.02 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  42.42 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  29.52 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>