191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0096 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  100 
 
 
464 aa  960    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  68.1 
 
 
462 aa  624  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  65.36 
 
 
459 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  62.96 
 
 
460 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  62.96 
 
 
460 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  62.75 
 
 
460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  62.96 
 
 
460 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  62.96 
 
 
460 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  62.23 
 
 
460 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  65.13 
 
 
414 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  64.89 
 
 
414 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  49.33 
 
 
445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  48.22 
 
 
445 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  46.45 
 
 
416 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  46.7 
 
 
416 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  46.94 
 
 
416 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  45.1 
 
 
413 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  46.7 
 
 
416 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  45.95 
 
 
413 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  45.95 
 
 
415 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  46.45 
 
 
414 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  44.72 
 
 
413 aa  358  8e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  44.69 
 
 
414 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  44.69 
 
 
421 aa  346  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  44.2 
 
 
421 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  44.2 
 
 
414 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  44.2 
 
 
421 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  35.78 
 
 
403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  39.43 
 
 
393 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  34.56 
 
 
398 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  34.95 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  33.33 
 
 
401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  33.99 
 
 
399 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  31.69 
 
 
400 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  32.43 
 
 
405 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  33.33 
 
 
398 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  33.9 
 
 
405 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.76 
 
 
413 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  33.74 
 
 
399 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  33.74 
 
 
399 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  33.08 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  32.86 
 
 
405 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  34.06 
 
 
399 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  33.75 
 
 
399 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  32.9 
 
 
414 aa  169  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.03 
 
 
410 aa  166  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  32.19 
 
 
394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  32.72 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.39 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  33.33 
 
 
399 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  31.41 
 
 
394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  31.66 
 
 
394 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  31.15 
 
 
394 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  31.15 
 
 
394 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  30.59 
 
 
397 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  32.41 
 
 
394 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.73 
 
 
399 aa  158  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.13 
 
 
376 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.52 
 
 
395 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  33.73 
 
 
413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  29.37 
 
 
397 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  31.32 
 
 
394 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.25 
 
 
409 aa  124  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  26.79 
 
 
413 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  26.29 
 
 
432 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  30.56 
 
 
432 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.13 
 
 
409 aa  113  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  28.82 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  27.93 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  31.22 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  27.34 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  26.38 
 
 
422 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  29.18 
 
 
429 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  28.61 
 
 
429 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  29.04 
 
 
423 aa  107  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  25.13 
 
 
411 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  25.2 
 
 
406 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  28.64 
 
 
429 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  29.04 
 
 
424 aa  103  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  28.79 
 
 
430 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  25.5 
 
 
427 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  28.36 
 
 
424 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  29.04 
 
 
430 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  26.88 
 
 
425 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.58 
 
 
399 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  28.1 
 
 
429 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.96 
 
 
425 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  28.03 
 
 
432 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  27.01 
 
 
415 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  28.64 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  27.41 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  27.42 
 
 
436 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  29.11 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.11 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  27.32 
 
 
440 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  27.85 
 
 
425 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  25.3 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  24.33 
 
 
426 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  25.3 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  25.3 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>