47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0093 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  68.48 
 
 
330 aa  437  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  68.79 
 
 
330 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  68.79 
 
 
330 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  63.25 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  62.35 
 
 
330 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  57.7 
 
 
331 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  57.4 
 
 
331 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  57.1 
 
 
331 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  57.4 
 
 
331 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  57.1 
 
 
331 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  58.31 
 
 
331 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  58.61 
 
 
331 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  58.61 
 
 
331 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  58.31 
 
 
331 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  57.1 
 
 
331 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  58.61 
 
 
331 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  58.61 
 
 
331 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  58.01 
 
 
331 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  58.01 
 
 
331 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  27.4 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  27.4 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  27.4 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  27.4 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  27.12 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  27.67 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  24.61 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  32.33 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  27.23 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  25.22 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  27.15 
 
 
352 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  32.11 
 
 
375 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  29.17 
 
 
337 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1141  hypothetical protein  24.43 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  hitchhiker  0.0000472475 
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  24.57 
 
 
339 aa  49.3  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1180  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0744588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  29.17 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  45.16 
 
 
384 aa  47  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  25.81 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  26.57 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3034  hypothetical protein  29.1 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2569  hypothetical protein  27.92 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.626999  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2961  hypothetical protein  29.1 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1862  hypothetical protein  29.1 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.378976  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1833  acyltransferase 3  36.49 
 
 
371 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2465  acyltransferase 3  32.26 
 
 
362 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4191  hypothetical protein  28.83 
 
 
370 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>