More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0092 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  81.04 
 
 		 386 aa  638    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0092  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  819    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  81.13 
 
 		 409 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  80.64 
 
 		 409 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  72.24 
 
 		 410 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  72.24 
 
 		 410 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  72.24 
 
 		 410 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  72.24 
 
 		 410 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  72.48 
 
 		 410 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  71.99 
 
 		 410 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  73.37 
 
 		 411 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  71.99 
 
 		 410 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  71.74 
 
 		 410 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0902  multidrug resistance protein MdtM  72.41 
 
 		 410 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0938  multidrug resistance protein MdtM  72.41 
 
 		 410 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0999  multidrug resistance protein MdtM  72.41 
 
 		 410 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0970  multidrug resistance protein MdtM  72.24 
 
 		 410 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1018  multidrug resistance protein MdtM  72.41 
 
 		 410 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283578  normal  0.445773 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4767  multidrug resistance protein MdtM  42.6 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04206  multidrug efflux system protein  42.6 
 
 		 410 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.652544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3658  major facilitator superfamily MFS_1  42.6 
 
 		 410 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04169  hypothetical protein  42.6 
 
 		 410 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.596573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4565  multidrug resistance protein MdtM  42.35 
 
 		 410 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4939  multidrug resistance protein MdtM  42.39 
 
 		 410 aa  329  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5851  multidrug resistance protein MdtM  42.09 
 
 		 410 aa  328  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.720836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4884  multidrug resistance protein MdtM  42.35 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4848  multidrug resistance protein MdtM  42.35 
 
 		 413 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4920  multidrug resistance protein MdtM  42.35 
 
 		 413 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.998541  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4922  multidrug resistance protein MdtM  42.35 
 
 		 413 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.353329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4872  multidrug resistance protein MdtM  42.35 
 
 		 413 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.891982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4774  multidrug resistance protein MdtM  42.35 
 
 		 413 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.158436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 413 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 414 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1360  hypothetical protein  43.9 
 
 		 426 aa  285  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1356  hypothetical protein  43.8 
 
 		 426 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2560  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.71 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.4 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.67 
 
 		 400 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.7 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.7 
 
 		 405 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.23 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.19 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  30.11 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.04 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.24 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.02 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.8 
 
 		 386 aa  106  9e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.47 
 
 		 392 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.47 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.39 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.76 
 
 		 400 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  27.81 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.01 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  26.94 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.37 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.3 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.47 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  24.3 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.37 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.86 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.62 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.62 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  28.96 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.41 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.57 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 422 aa  97.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.12 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.35 
 
 		 413 aa  97.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.92 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.46 
 
 		 411 aa  96.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.28 
 
 		 428 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.67 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.62 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  26.95 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.4 
 
 		 413 aa  96.7  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.95 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.2 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.71 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.9 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
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