25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0088 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0230  hypothetical protein  25.47 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0568  hypothetical protein  25.47 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3988  hypothetical protein  25.47 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.899089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4071  hypothetical protein  27.83 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3879  hypothetical protein  23.47 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3884  hypothetical protein  27.96 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0243  conserved hypothetical protein  24.65 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03274  hypothetical protein  24.65 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4792  hypothetical protein  24.65 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3850  hypothetical protein  24.65 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3756  hypothetical protein  24.65 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0244  hypothetical protein  24.65 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3954  hypothetical protein  24.65 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3671  hypothetical protein  24.65 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03321  periplasmic protein  24.65 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0203  hypothetical protein  23.18 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0628423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3849  hypothetical protein  22.07 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3892  hypothetical protein  22.07 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3772  hypothetical protein  22.07 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3782  hypothetical protein  22.07 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3952  hypothetical protein  22.07 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0085  hypothetical protein  25.45 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0089  hypothetical protein  24.09 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1619  hypothetical protein  25.58 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>