47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0067 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0067  autoinducer synthesis protein  100 
 
 		 224 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.719257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  61.35 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  54.07 
 
 		 217 aa  258  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0101  Acyl-homoserine-lactone synthase  55.73 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  47.39 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  47.39 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1546  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  44.93 
 
 		 214 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1656  autoinducer synthesis protein  44.93 
 
 		 214 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1716  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  44.93 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105822  hitchhiker  0.000229344 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0183  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  42.94 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0180575  hitchhiker  0.000000220703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  30.73 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  30.25 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  25.62 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  27.46 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  27.46 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  27.46 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  24.6 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  28.48 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  24.65 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2998  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  26.8 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  23.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  22.97 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  25.32 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  34.44 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  21.47 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  24.32 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  23.81 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  27.17 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  18.89 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  31.87 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  31.87 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  32.22 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  28.05 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  29.63 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  21.79 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  30.99 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  26.83 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  28.44 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  24.41 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  23.97 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  22.04 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  25.89 
 
 		 201 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  25.89 
 
 		 201 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0620  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  24.75 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  22.99 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>