103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0065 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  100 
 
 
662 aa  1341    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  54.92 
 
 
656 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  54.77 
 
 
656 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  54.77 
 
 
656 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  55.04 
 
 
584 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  27.17 
 
 
629 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  26.66 
 
 
629 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  25.78 
 
 
630 aa  138  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.5 
 
 
617 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  25.66 
 
 
629 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  28.18 
 
 
640 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  27.43 
 
 
640 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  25.34 
 
 
636 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  29.31 
 
 
626 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  27.62 
 
 
646 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3963  putative lipase  38 
 
 
234 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0770687  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4024  putative lipase  38 
 
 
234 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.266935  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  27.04 
 
 
646 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3920  putative lipase  37.33 
 
 
234 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.65815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3836  putative lipase  37.33 
 
 
234 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.172505  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3855  putative lipase  37.33 
 
 
234 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03398  hypothetical protein  37.33 
 
 
232 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4924  hypothetical protein  37.33 
 
 
232 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.335605  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03349  hypothetical protein  37.33 
 
 
232 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3869  hypothetical protein  37.33 
 
 
232 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4043  hypothetical protein  36.67 
 
 
232 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3978  hypothetical protein  36.67 
 
 
232 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  28.34 
 
 
594 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0164  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 
232 aa  114  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3750  hypothetical protein  36.67 
 
 
232 aa  114  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0168  putative lipase  36.67 
 
 
232 aa  114  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0176  putative lipase  37.33 
 
 
234 aa  112  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.841932  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  26.96 
 
 
628 aa  110  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  24.49 
 
 
597 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  24.24 
 
 
597 aa  101  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  28.18 
 
 
647 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  25.75 
 
 
628 aa  92  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  27.41 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  27.61 
 
 
319 aa  77  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  26.53 
 
 
288 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.57 
 
 
650 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  27.88 
 
 
647 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  26.92 
 
 
647 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.87 
 
 
629 aa  67  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  24.39 
 
 
658 aa  64.3  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.86 
 
 
641 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.64 
 
 
418 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  29.73 
 
 
309 aa  60.5  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  24.62 
 
 
610 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.62 
 
 
610 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  27.71 
 
 
1222 aa  60.8  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  24.62 
 
 
610 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  29.73 
 
 
309 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  32.53 
 
 
310 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  43.01 
 
 
329 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.62 
 
 
610 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.62 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  43.01 
 
 
329 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  25.49 
 
 
366 aa  58.9  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  22.85 
 
 
607 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.78 
 
 
610 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  24.63 
 
 
610 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  26.42 
 
 
339 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3287  lipolytic protein G-D-S-L family  27.78 
 
 
379 aa  55.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  24.74 
 
 
353 aa  55.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  25.31 
 
 
403 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  28.57 
 
 
320 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.57 
 
 
816 aa  53.9  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.38 
 
 
972 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0978  GDSL family lipase  31.82 
 
 
377 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  26.18 
 
 
372 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  39.29 
 
 
347 aa  52  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  27.45 
 
 
1012 aa  52  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  31.9 
 
 
429 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4567  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  33.33 
 
 
364 aa  52  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  24.7 
 
 
627 aa  51.2  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.17 
 
 
1673 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  22.86 
 
 
284 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.9 
 
 
375 aa  50.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  23.53 
 
 
341 aa  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.92 
 
 
330 aa  48.5  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  21.51 
 
 
939 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  25.19 
 
 
684 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  26.49 
 
 
1672 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  26.5 
 
 
379 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.14 
 
 
375 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  32.77 
 
 
315 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  26.5 
 
 
379 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  26.5 
 
 
379 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  26.5 
 
 
379 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.63 
 
 
418 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  31.67 
 
 
316 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  26.5 
 
 
379 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  26.5 
 
 
379 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  26.5 
 
 
379 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  27.59 
 
 
349 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  25.96 
 
 
379 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0053  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.97 
 
 
326 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.687588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.48 
 
 
379 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2313  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  29.13 
 
 
340 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0175563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>