More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0059 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  71.7 
 
 
312 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  67.65 
 
 
328 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  66.56 
 
 
330 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  66.23 
 
 
330 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  65.91 
 
 
330 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  65.58 
 
 
330 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  66.23 
 
 
327 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  65.91 
 
 
330 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  66.34 
 
 
327 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  65.8 
 
 
329 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  65.91 
 
 
330 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  65.15 
 
 
329 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  65.15 
 
 
329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  65.15 
 
 
329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  65.8 
 
 
329 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  65.03 
 
 
320 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  62.46 
 
 
329 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  63.07 
 
 
329 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  59.02 
 
 
316 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  56.17 
 
 
314 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  56.82 
 
 
315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  58.03 
 
 
316 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  58.03 
 
 
316 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  55.05 
 
 
345 aa  348  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  53.75 
 
 
340 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  56.17 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  56.17 
 
 
316 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  54.37 
 
 
314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  54.46 
 
 
319 aa  335  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  56.07 
 
 
316 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  54.6 
 
 
324 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  51.62 
 
 
317 aa  320  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  52.51 
 
 
306 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.37 
 
 
320 aa  250  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  45.83 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.58 
 
 
320 aa  239  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  37.91 
 
 
313 aa  230  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  43.56 
 
 
317 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  38.67 
 
 
301 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  35.65 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  37.94 
 
 
320 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  37.33 
 
 
301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  36.18 
 
 
339 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  36.16 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  40.07 
 
 
321 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  37.15 
 
 
344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  39.68 
 
 
321 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  34.2 
 
 
314 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  34.53 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  34.54 
 
 
323 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  36.19 
 
 
318 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  34.2 
 
 
315 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.72 
 
 
313 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  34.69 
 
 
326 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  29.65 
 
 
323 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.25 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  29.81 
 
 
322 aa  135  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  31.53 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  31.53 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 
315 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 
320 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  31.21 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  31.21 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  31.21 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.11 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  31.21 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  32.46 
 
 
311 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.68 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  29.9 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  31.21 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  32.39 
 
 
312 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.14 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  32.26 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.82 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  32.89 
 
 
309 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  33.33 
 
 
327 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.78 
 
 
320 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 
308 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  34.31 
 
 
363 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  31.17 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  31.17 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  29.27 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  30.65 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  33.11 
 
 
312 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  28.96 
 
 
645 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  28.96 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  28.96 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  36.22 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 
308 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 
308 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  26.17 
 
 
338 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  28.96 
 
 
332 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  32.79 
 
 
308 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  30.55 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  28.35 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  31.49 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  33.01 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>