More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0058 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  76.61 
 
 
424 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  76.92 
 
 
426 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  75.71 
 
 
425 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  77.43 
 
 
426 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  75.95 
 
 
425 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  77.43 
 
 
426 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  75.95 
 
 
425 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  75.95 
 
 
425 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  77.11 
 
 
426 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  76.43 
 
 
429 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  100 
 
 
422 aa  844    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  76.92 
 
 
426 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  76.44 
 
 
426 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  76.63 
 
 
431 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  85.48 
 
 
426 aa  732    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  76.92 
 
 
426 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  76.57 
 
 
426 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  76.44 
 
 
426 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  76.19 
 
 
425 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  72.6 
 
 
432 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  70.48 
 
 
435 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  70.24 
 
 
435 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  70.95 
 
 
430 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  70.71 
 
 
430 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  70.95 
 
 
430 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  70.71 
 
 
462 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  71.03 
 
 
432 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  66.75 
 
 
432 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  63.81 
 
 
426 aa  555  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  63.81 
 
 
432 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  63.9 
 
 
440 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  61.63 
 
 
423 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 
433 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 
433 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  35.15 
 
 
428 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 
444 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 
444 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 
444 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  36.79 
 
 
443 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  35.58 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  35.58 
 
 
430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  35.58 
 
 
430 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  35.34 
 
 
430 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  35.58 
 
 
430 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  36.58 
 
 
431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  35.1 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  33.77 
 
 
435 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  32.78 
 
 
438 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  31.3 
 
 
432 aa  219  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  32.78 
 
 
438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
423 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  31.21 
 
 
427 aa  206  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  32.29 
 
 
426 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  32.37 
 
 
435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  32.28 
 
 
435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.55 
 
 
429 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  31.18 
 
 
439 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
449 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  31.4 
 
 
453 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  31.34 
 
 
439 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  29.64 
 
 
440 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  29.97 
 
 
444 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 
424 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  32.56 
 
 
443 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  30.7 
 
 
440 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
439 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  30.14 
 
 
437 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  29.79 
 
 
428 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  28.74 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  31.25 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  33.9 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
462 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  28.95 
 
 
437 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  31.25 
 
 
434 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  29.9 
 
 
442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  29.11 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  29.79 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  29.11 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  30.31 
 
 
443 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  31.59 
 
 
433 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  31.14 
 
 
433 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  33.25 
 
 
435 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  33.25 
 
 
435 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  29.66 
 
 
443 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  28.37 
 
 
442 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  28.4 
 
 
451 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
440 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  33.66 
 
 
435 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  31.8 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
444 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  31.87 
 
 
439 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  34.06 
 
 
435 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 
432 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
440 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  31.04 
 
 
448 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  31.04 
 
 
448 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  32.05 
 
 
443 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  31.04 
 
 
448 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  30.44 
 
 
432 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  30.71 
 
 
456 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>