More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0053 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  81.2 
 
 		 417 aa  705    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  80.96 
 
 		 417 aa  704    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  81.93 
 
 		 418 aa  727    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  82.65 
 
 		 416 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  82.41 
 
 		 416 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  86.07 
 
 		 456 aa  789    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  80.96 
 
 		 417 aa  703    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  88.89 
 
 		 402 aa  726    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  81.69 
 
 		 417 aa  710    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  84.1 
 
 		 416 aa  749    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  82.41 
 
 		 416 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  88.67 
 
 		 421 aa  776    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  80.72 
 
 		 417 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  82.65 
 
 		 416 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  81.2 
 
 		 417 aa  705    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  82.65 
 
 		 416 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 440 aa  910    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  81.69 
 
 		 416 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  81.2 
 
 		 417 aa  705    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  81.2 
 
 		 417 aa  705    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  85.44 
 
 		 417 aa  754    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  80.96 
 
 		 417 aa  703    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  81.2 
 
 		 417 aa  705    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  66.75 
 
 		 417 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  66.27 
 
 		 417 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  65.78 
 
 		 415 aa  596  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  64.82 
 
 		 418 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  66.1 
 
 		 419 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  65.3 
 
 		 416 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  64.75 
 
 		 420 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  55.07 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  51.43 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  47.03 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  45.08 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  45.31 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  44.39 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  45.11 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  42.32 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  40.34 
 
 		 421 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  38.57 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  38.22 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  37.98 
 
 		 427 aa  305  7e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  37.74 
 
 		 419 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  37.05 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  25.82 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  25.25 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  27.64 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  25.51 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  26.47 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  24.62 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  23.87 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  25.56 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  25.93 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  25.93 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  25.43 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  25.48 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  25.92 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  25.91 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  24.05 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  25.72 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  25.06 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  23.09 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  23.31 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  25.43 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  23.87 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  25.63 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  23.66 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  25.77 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  23.6 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  24 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  28.12 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  24 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  25.71 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  23.4 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>