More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4200 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  63.58 
 
 		 183 aa  188  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  61.27 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  53.8 
 
 		 164 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  53.8 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  53.8 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  53.16 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  53.8 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  53.8 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  53.8 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  55.94 
 
 		 164 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  55.94 
 
 		 164 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  49.13 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  49.13 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  49.13 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  49.13 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  49.13 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  49.13 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  49.13 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  49.13 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  49.13 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  47.13 
 
 		 189 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  47.43 
 
 		 190 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  47.43 
 
 		 190 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  47.43 
 
 		 190 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  52.48 
 
 		 171 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  49.37 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  43.18 
 
 		 194 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  40.91 
 
 		 191 aa  157  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  43.18 
 
 		 194 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  45.35 
 
 		 191 aa  155  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  55.83 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  55.83 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  47.74 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  54.62 
 
 		 196 aa  153  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  51.63 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  47.06 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  46.94 
 
 		 179 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  48.43 
 
 		 162 aa  150  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  50.66 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  43.03 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  48.08 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  41.95 
 
 		 194 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  44.72 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  49.34 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  41.38 
 
 		 193 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  45.57 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  44.94 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  44.94 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  44.94 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  44.94 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  44.3 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  44.3 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  44.3 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  44.3 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  44.3 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  47.71 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 189 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  48.32 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  44.23 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  43.79 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  46.2 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  46.2 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  46.2 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  48.8 
 
 		 205 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  46.2 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  40.72 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  46.76 
 
 		 265 aa  124  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  50.77 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  49.17 
 
 		 195 aa  121  4e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 333 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  40.37 
 
 		 173 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  38.93 
 
 		 211 aa  110  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  46.9 
 
 		 214 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  46.15 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  47.06 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  40 
 
 		 274 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 208 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 205 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  37.66 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  36.69 
 
 		 231 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  40.44 
 
 		 246 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 246 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  40.14 
 
 		 169 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  43.08 
 
 		 228 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  32.79 
 
 		 205 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 201 aa  104  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  42.31 
 
 		 226 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  32.37 
 
 		 184 aa  103  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  33.71 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  37.89 
 
 		 248 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  41.5 
 
 		 223 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  41.5 
 
 		 223 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>