15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4187 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4187  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  851    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4861  hypothetical protein  43.78 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3777  hypothetical protein  43.36 
 
 
420 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0076  hypothetical protein  40.24 
 
 
436 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0079  hypothetical protein  40 
 
 
436 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4275  hypothetical protein  40 
 
 
436 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0074  hypothetical protein  40 
 
 
436 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3974  hypothetical protein  40.14 
 
 
430 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0079  hypothetical protein  38.86 
 
 
436 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0077  hypothetical protein  38.86 
 
 
436 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0075  hypothetical protein  38.86 
 
 
436 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0074  hypothetical protein  39.59 
 
 
435 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0060  hypothetical protein  37.62 
 
 
438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0071  hypothetical protein  37.34 
 
 
438 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3572  hypothetical protein  30.16 
 
 
413 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>