251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4183 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
142 aa  296  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  80.99 
 
 
144 aa  251  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  81.43 
 
 
141 aa  246  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  72.34 
 
 
143 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  72.14 
 
 
140 aa  224  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  73.94 
 
 
154 aa  221  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  73.94 
 
 
142 aa  221  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  73.24 
 
 
154 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  73.05 
 
 
150 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  73.24 
 
 
154 aa  218  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  72.54 
 
 
146 aa  215  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  72.54 
 
 
150 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  72.54 
 
 
142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  72.54 
 
 
150 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  65.47 
 
 
142 aa  192  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  60 
 
 
149 aa  186  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  61.83 
 
 
144 aa  174  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  58.59 
 
 
150 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  59.38 
 
 
150 aa  167  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
139 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  41.82 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  37.01 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
161 aa  90.1  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  36 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  27.34 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  31.4 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  32.23 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  40.85 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  38.03 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03599  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 
294 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  27.48 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  25.19 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.87 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  27.54 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  26.09 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  40.54 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.2 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.33 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.32 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.33 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.32 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.33 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.32 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.29 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 
213 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  28.35 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  29.13 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>