More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4071 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4104  choline/carnitine/betaine transporter  90.29 
 
 		 650 aa  1201    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03056  hypothetical protein  76.16 
 
 		 632 aa  991    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0014  choline/carnitine/betaine transporter  59.64 
 
 		 584 aa  683    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4071  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 650 aa  1312    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00106  putative choline-glycine betaine transporter  65.05 
 
 		 586 aa  743    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000396  choline-glycine betaine transporter  71.72 
 
 		 593 aa  848    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2691  choline transporter  49.6 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2637  choline transporter  49.6 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2179  choline/carnitine/betaine transporter  45.74 
 
 		 540 aa  495  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1338  choline/carnitine/betaine transporter  38.04 
 
 		 542 aa  359  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4909  choline/carnitine/betaine transporter  37.24 
 
 		 527 aa  340  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2342  BCCT transporter  39.83 
 
 		 525 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3247  BCCT transporter  35 
 
 		 532 aa  328  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4862  putative carnitine transporter CglC  36.06 
 
 		 513 aa  327  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.905862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0569  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  36.57 
 
 		 507 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1261  choline/carnitine/betaine transporter family protein  37.68 
 
 		 522 aa  313  4.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177229  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1754  putative transporter  33.8 
 
 		 548 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1618  putative transporter  33.6 
 
 		 548 aa  313  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1515  putative transporter  33.6 
 
 		 548 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1731  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  36.96 
 
 		 508 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1387  putative transporter  33.52 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.216138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1889  putative transporter  33.46 
 
 		 536 aa  308  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2527  putative transporter  33.33 
 
 		 536 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.951849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2027  putative transporter  33.33 
 
 		 536 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.12575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2195  putative transporter  34.52 
 
 		 532 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.528619  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01771  predicted transporter  33.98 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01759  hypothetical protein  33.98 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1832  putative transporter  33.98 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.301874 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1842  choline/carnitine/betaine transporter  33.99 
 
 		 476 aa  291  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.220871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  35.04 
 
 		 503 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  38.43 
 
 		 523 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  32.87 
 
 		 551 aa  281  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  35.17 
 
 		 550 aa  280  5e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  33.73 
 
 		 606 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0080  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.97 
 
 		 505 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.682648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0078  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.97 
 
 		 505 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0082  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.97 
 
 		 505 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.508572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0081  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.97 
 
 		 505 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0078  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.97 
 
 		 505 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  34.09 
 
 		 490 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  32.2 
 
 		 659 aa  273  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  34.83 
 
 		 538 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  32.2 
 
 		 659 aa  272  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  32.86 
 
 		 526 aa  272  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  33.14 
 
 		 542 aa  270  5e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  28.95 
 
 		 657 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3615  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.55 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0404  choline/carnitine/betaine transporter  31.76 
 
 		 667 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.766464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  33.68 
 
 		 637 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0041  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.55 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.206145  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3559  choline/carnitine/betaine transporter  33.55 
 
 		 504 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.55 
 
 		 504 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0042  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.55 
 
 		 504 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  33.85 
 
 		 671 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.55 
 
 		 504 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00043  hypothetical protein  33.55 
 
 		 504 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.721093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  35.21 
 
 		 498 aa  266  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5061  choline/carnitine/betaine transporter  31.37 
 
 		 667 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  33.07 
 
 		 520 aa  265  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  33.07 
 
 		 520 aa  265  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4934  choline/carnitine/betaine transporter  31.37 
 
 		 667 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04020  choline/carnitine/betaine transport  33.93 
 
 		 609 aa  264  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0187444  normal  0.0477577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5112  choline/carnitine/betaine transporter  31.37 
 
 		 667 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  34.24 
 
 		 653 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6160  choline transporter BetT  31.82 
 
 		 534 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3229  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.73 
 
 		 514 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.33 
 
 		 504 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  34.23 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  29.95 
 
 		 660 aa  260  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4752  BCCT transporter  31.73 
 
 		 536 aa  261  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.337094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  33.6 
 
 		 506 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  32.43 
 
 		 530 aa  260  7e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3107  choline/carnitine/betaine transporter  33.76 
 
 		 539 aa  260  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  35.39 
 
 		 661 aa  259  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  31.31 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  34.24 
 
 		 685 aa  259  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5241  BCCT transporter  33.06 
 
 		 665 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151008  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  29.75 
 
 		 681 aa  258  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  33.06 
 
 		 600 aa  258  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  34.42 
 
 		 508 aa  257  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  36.45 
 
 		 656 aa  257  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  28.76 
 
 		 681 aa  256  7e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  31.17 
 
 		 542 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  33.06 
 
 		 545 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4038  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.27 
 
 		 519 aa  256  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2934  BCCT transporter  33.52 
 
 		 545 aa  256  9e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  33.01 
 
 		 514 aa  256  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  33.88 
 
 		 682 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  33.8 
 
 		 538 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 505 aa  253  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  32.91 
 
 		 568 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  32.53 
 
 		 505 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  32.53 
 
 		 505 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3745  choline/carnitine/betaine transporter  32.03 
 
 		 724 aa  253  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  36.53 
 
 		 573 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2676  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.48 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>