133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4059 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  62.3 
 
 
183 aa  243  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  61.33 
 
 
183 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  60.8 
 
 
183 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  60.66 
 
 
183 aa  236  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  60.8 
 
 
183 aa  236  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  60.8 
 
 
183 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  61.2 
 
 
183 aa  235  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  60.11 
 
 
183 aa  230  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  58.01 
 
 
184 aa  227  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  58.01 
 
 
183 aa  228  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  58.01 
 
 
184 aa  227  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  63.47 
 
 
183 aa  227  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  58.01 
 
 
183 aa  228  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  58.01 
 
 
183 aa  228  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  58.01 
 
 
183 aa  228  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  58.01 
 
 
183 aa  228  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  58.01 
 
 
183 aa  228  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  58.01 
 
 
183 aa  228  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  56.91 
 
 
183 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  56.91 
 
 
183 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  56.91 
 
 
183 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  56.91 
 
 
183 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  56.91 
 
 
183 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  61.93 
 
 
183 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  56.82 
 
 
181 aa  214  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  57.98 
 
 
187 aa  214  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  56.25 
 
 
181 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  57.06 
 
 
193 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  60 
 
 
189 aa  201  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  47.51 
 
 
186 aa  175  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  46.41 
 
 
182 aa  164  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  45.9 
 
 
188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.2 
 
 
182 aa  159  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  37.57 
 
 
187 aa  154  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  42.7 
 
 
178 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  44.31 
 
 
174 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.34 
 
 
186 aa  142  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  39.46 
 
 
188 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  34.59 
 
 
181 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  33.51 
 
 
185 aa  117  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.98 
 
 
186 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  34.5 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  31.58 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.39 
 
 
187 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 
180 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  32 
 
 
184 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  34.64 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  38.71 
 
 
188 aa  98.6  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  30.23 
 
 
184 aa  87  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  30.77 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.95 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.03 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.78 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.98 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 
158 aa  58.2  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.65 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  27.75 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  26.32 
 
 
254 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.82 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  29.21 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.39 
 
 
168 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  25.84 
 
 
254 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  26.6 
 
 
239 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  27.84 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.94 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  26.4 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  27.16 
 
 
177 aa  52  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  32.56 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.98 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.46 
 
 
222 aa  51.6  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.84 
 
 
234 aa  51.6  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  30.3 
 
 
167 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  30.3 
 
 
167 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.65 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.84 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  31.62 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.82 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.88 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.77 
 
 
222 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1656  metallophosphoesterase  26.39 
 
 
278 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.865834  normal  0.107408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  27.65 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  25.7 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  25.7 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  25.14 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  25.7 
 
 
167 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  33.98 
 
 
162 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.05 
 
 
223 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.3 
 
 
227 aa  47.8  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  25.14 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  25.14 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  25.14 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  25.14 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  23.24 
 
 
171 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.67 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  24.58 
 
 
167 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
240 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  24.39 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  25.88 
 
 
167 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4521  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
244 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>