More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4053 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  100 
 
 		 465 aa  939    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  56.61 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  56.17 
 
 		 468 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  46.15 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  45.68 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  46.15 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  46.33 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  32.5 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  34.57 
 
 		 443 aa  240  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  33.18 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  33.18 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  33.18 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  33.82 
 
 		 448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  32.37 
 
 		 451 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  32.37 
 
 		 451 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  32.59 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.59 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  32.3 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  32.58 
 
 		 456 aa  226  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  32.86 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.69 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  31 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 447 aa  216  7e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  32.44 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30.25 
 
 		 467 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.22 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.39 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 449 aa  186  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 448 aa  186  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.76 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 442 aa  179  9e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 442 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 452 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 451 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.52 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.52 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.76 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.06 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 455 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.16 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  28.34 
 
 		 456 aa  163  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.61 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.65 
 
 		 446 aa  161  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  29.31 
 
 		 464 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 461 aa  159  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 460 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.26 
 
 		 459 aa  146  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.32 
 
 		 455 aa  146  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 447 aa  142  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.36 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.05 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 470 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  26.21 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 451 aa  126  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  25.17 
 
 		 451 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.94 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  25.36 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.06 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.4 
 
 		 450 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  24.07 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>