99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4048 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  100 
 
 		 764 aa  1599    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  33.87 
 
 		 785 aa  389  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  26.96 
 
 		 639 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  26.54 
 
 		 639 aa  231  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  26.9 
 
 		 639 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  26.18 
 
 		 639 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  25.97 
 
 		 639 aa  227  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.47 
 
 		 639 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  27.76 
 
 		 650 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  27.61 
 
 		 650 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  27.5 
 
 		 650 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  27.49 
 
 		 640 aa  220  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  28.23 
 
 		 646 aa  220  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  27.5 
 
 		 650 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  26.46 
 
 		 639 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  27.58 
 
 		 650 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  27.89 
 
 		 650 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  30.25 
 
 		 639 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  30.06 
 
 		 639 aa  207  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  29.84 
 
 		 639 aa  206  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  30.65 
 
 		 663 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  24.62 
 
 		 656 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  25.31 
 
 		 655 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  32.75 
 
 		 667 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  29.27 
 
 		 671 aa  146  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  24.28 
 
 		 653 aa  145  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  28.85 
 
 		 671 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  24.14 
 
 		 656 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  25.32 
 
 		 714 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  23.81 
 
 		 822 aa  128  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  26.93 
 
 		 660 aa  127  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  23.21 
 
 		 727 aa  105  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  25.55 
 
 		 898 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  23.95 
 
 		 720 aa  104  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  22.93 
 
 		 719 aa  102  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  25.41 
 
 		 898 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  24.5 
 
 		 898 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  22.13 
 
 		 738 aa  98.2  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  21.6 
 
 		 745 aa  92.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  21.52 
 
 		 731 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  26.88 
 
 		 724 aa  88.2  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 		 725 aa  88.2  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  22.53 
 
 		 722 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  22.93 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  22.87 
 
 		 778 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  22.27 
 
 		 731 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  21.33 
 
 		 735 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  21.14 
 
 		 729 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 		 724 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  20.95 
 
 		 729 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  21.47 
 
 		 833 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  23.85 
 
 		 730 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  22.44 
 
 		 745 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  23.46 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  23.31 
 
 		 730 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  23.31 
 
 		 730 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  25.39 
 
 		 782 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  21.56 
 
 		 936 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  22.52 
 
 		 716 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  23.18 
 
 		 885 aa  67.8  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  20.99 
 
 		 789 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  25.42 
 
 		 612 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  23.9 
 
 		 945 aa  62.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  26.05 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  21.03 
 
 		 755 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  23.39 
 
 		 687 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  21.87 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  20.93 
 
 		 757 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  24.94 
 
 		 764 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  23.99 
 
 		 826 aa  55.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  21.28 
 
 		 893 aa  55.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  25.77 
 
 		 766 aa  54.3  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  23.51 
 
 		 642 aa  54.3  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  25.5 
 
 		 843 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  22.27 
 
 		 762 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  23.56 
 
 		 657 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.1 
 
 		 770 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  26.62 
 
 		 333 aa  48.9  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  24.32 
 
 		 329 aa  48.5  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  29.5 
 
 		 436 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  31.4 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  29.5 
 
 		 436 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  26.62 
 
 		 333 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  28.78 
 
 		 436 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  26.62 
 
 		 333 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  31.4 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  23.78 
 
 		 333 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  26.62 
 
 		 333 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  22.3 
 
 		 742 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.66 
 
 		 788 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  26.62 
 
 		 329 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  22.3 
 
 		 742 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  26.62 
 
 		 329 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  24.84 
 
 		 328 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  24.32 
 
 		 333 aa  45.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.47 
 
 		 754 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  24.66 
 
 		 789 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  22.7 
 
 		 326 aa  43.9  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  25.97 
 
 		 329 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>