More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4007 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  59.53 
 
 		 218 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  62.38 
 
 		 214 aa  267  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  55.5 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  51.44 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  51.44 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  51.44 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  52.36 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  51.44 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  51.23 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  51.23 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  50.49 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  51.23 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  54.41 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  53.44 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  42.18 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  41.82 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  49.66 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  43.55 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  38.89 
 
 		 220 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  39.74 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  40.71 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  35.11 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  38.01 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  34.31 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
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NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  39.62 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.05 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 210 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
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NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  38.57 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  33.15 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.57 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  40.14 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  39.22 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  33.15 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  38.41 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  36.5 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  32.42 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  37.33 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.68 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  33.13 
 
 		 291 aa  101  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  30.69 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  35.46 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  33.54 
 
 		 297 aa  101  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  41.35 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.75 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  38.93 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  32.22 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  32.6 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  37.16 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  32.2 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  32.2 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  32.2 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  32.2 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  32.2 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  34.94 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  32.78 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.59 
 
 		 181 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.59 
 
 		 181 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  34.51 
 
 		 287 aa  97.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  39.69 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35.98 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.7 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  34.94 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  35.66 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.7 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  31.07 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  36.64 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  38.28 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.68 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  25.38 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  30.58 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
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