More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3868 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 404 aa  832    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  28.95 
 
 		 367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  28.78 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  28.32 
 
 		 366 aa  137  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  28.19 
 
 		 372 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  28.19 
 
 		 372 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  28.46 
 
 		 377 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  27.03 
 
 		 368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  28.19 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  27.25 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  27.57 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.23 
 
 		 350 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.23 
 
 		 350 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  34.65 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  32.86 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.84 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  37.02 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.47 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.18 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.14 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 356 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.31 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40.14 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.07 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  26.56 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.44 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.44 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.44 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.48 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 237 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  32.6 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  36.2 
 
 		 239 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  36.2 
 
 		 239 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.55 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.52 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 264 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  38.26 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  35.26 
 
 		 204 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  27.82 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.1 
 
 		 337 aa  92.8  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  36.48 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  36.48 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.85 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  35.5 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  32.65 
 
 		 420 aa  89.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.91 
 
 		 244 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  24.42 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  25.46 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  36.17 
 
 		 201 aa  87.4  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  34.87 
 
 		 208 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  32.26 
 
 		 333 aa  86.7  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.01 
 
 		 321 aa  86.3  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  26.33 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  39.31 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.67 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  31.91 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  25.53 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  29.61 
 
 		 209 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  35.46 
 
 		 202 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  32.68 
 
 		 212 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  32.9 
 
 		 204 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  34.04 
 
 		 201 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  34.97 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  30.91 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  23.33 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  26.06 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  33.55 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  28.81 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  36.84 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  36.52 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  32.05 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  28.99 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  29.6 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  26.8 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  31.01 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  32.47 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  23.73 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  34.43 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.43 
 
 		 3544 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  31.16 
 
 		 201 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  30.51 
 
 		 201 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>