More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3761 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  100 
 
 
178 aa  359  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.02365e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  53.63 
 
 
173 aa  171  6e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.58454e-05  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  53.93 
 
 
176 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.43336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  52.15 
 
 
171 aa  151  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  52 
 
 
172 aa  151  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  49.46 
 
 
182 aa  147  1e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  47.85 
 
 
186 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.97616e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  48.89 
 
 
174 aa  145  4e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  5.13166e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  52.35 
 
 
170 aa  140  1e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  52.38 
 
 
173 aa  132  2e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  46.74 
 
 
168 aa  130  1e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  44.32 
 
 
159 aa  129  2e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  44.07 
 
 
169 aa  128  4e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.94883e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  45.93 
 
 
163 aa  125  4e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  43.33 
 
 
173 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  42.37 
 
 
169 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  43.41 
 
 
169 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  45.71 
 
 
166 aa  119  2e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  46.15 
 
 
172 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.12537e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  41.81 
 
 
169 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  41.53 
 
 
172 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.27612e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  44.57 
 
 
172 aa  117  8e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  45.09 
 
 
175 aa  109  2e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.46782e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  40.23 
 
 
157 aa  108  4e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  43.58 
 
 
169 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.41512e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  41.57 
 
 
165 aa  104  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  41.8 
 
 
168 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  43.14 
 
 
151 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  41.34 
 
 
169 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  52.78 
 
 
156 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  36.09 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  53.12 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  43.8 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  35.43 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  35.96 
 
 
166 aa  92  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  42.31 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  34.43 
 
 
170 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  53.16 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  38.6 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  34.03 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  9.43511e-10 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  57.53 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  34.55 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  35 
 
 
167 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  34.22 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  33.51 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  35.95 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  56.52 
 
 
163 aa  83.2  2e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  37.22 
 
 
176 aa  82  4e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  31.15 
 
 
164 aa  78.2  5e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  31.15 
 
 
164 aa  78.2  5e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  31.15 
 
 
164 aa  77.8  7e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  47.56 
 
 
182 aa  77.8  7e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  32.96 
 
 
172 aa  78.2  7e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  38.67 
 
 
172 aa  75.9  3e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  47.37 
 
 
169 aa  75.5  3e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  45.54 
 
 
179 aa  75.9  3e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  61.54 
 
 
182 aa  75.1  4e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  39.62 
 
 
173 aa  75.1  4e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  33.7 
 
 
172 aa  75.1  5e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  33.7 
 
 
172 aa  75.1  5e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  57.81 
 
 
174 aa  74.3  8e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  33.15 
 
 
172 aa  73.6  1e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  33.15 
 
 
172 aa  73.6  1e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  56.25 
 
 
174 aa  72.4  3e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  50.75 
 
 
156 aa  72.4  3e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  36 
 
 
218 aa  72  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.24061e-08  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  33.16 
 
 
177 aa  71.2  6e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  46.38 
 
 
163 aa  71.6  6e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  55.38 
 
 
186 aa  69.7  2e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  47.83 
 
 
163 aa  69.3  3e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  40.59 
 
 
205 aa  68.9  4e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  4.93749e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  40.59 
 
 
205 aa  68.6  5e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  41.12 
 
 
187 aa  68.6  5e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  40.59 
 
 
205 aa  68.6  5e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  40.2 
 
 
205 aa  67.4  1e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.6206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  40.2 
 
 
205 aa  67.4  1e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  52.31 
 
 
178 aa  67  1e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  54.84 
 
 
185 aa  67.4  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  40.2 
 
 
205 aa  67.4  1e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.65015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  40.2 
 
 
205 aa  67.4  1e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.75672e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  54.69 
 
 
186 aa  66.2  2e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  39.6 
 
 
205 aa  66.6  2e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  7.95599e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  38.61 
 
 
219 aa  65.5  3e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.16241e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  53.97 
 
 
185 aa  65.1  5e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  38 
 
 
205 aa  64.7  6e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  53.97 
 
 
193 aa  65.1  6e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  62.75 
 
 
108 aa  64.3  8e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.70582e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  39.62 
 
 
187 aa  64.3  8e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  38.46 
 
 
187 aa  63.9  1e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  38.46 
 
 
187 aa  63.9  1e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  38.46 
 
 
187 aa  64.3  1e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  47.95 
 
 
197 aa  63.5  1e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  38.24 
 
 
125 aa  63.5  2e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000280  MSHA pilin protein MshA  66.18 
 
 
176 aa  63.2  2e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.528287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  42.03 
 
 
212 aa  62.8  2e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  52.63 
 
 
205 aa  63.5  2e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  8.85834e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  47.54 
 
 
202 aa  62.8  3e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.62752e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  40.2 
 
 
180 aa  62.8  3e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1388  methylation site containing protein  30.73 
 
 
175 aa  62.4  3e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  44 
 
 
191 aa  62  5e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>