135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3746 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  77.33 
 
 		 473 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  77.9 
 
 		 489 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  77.9 
 
 		 489 aa  698    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  71.02 
 
 		 477 aa  677    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  78.52 
 
 		 489 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  77.05 
 
 		 493 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  77.24 
 
 		 467 aa  712    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  77.05 
 
 		 489 aa  692    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  80 
 
 		 473 aa  749    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 463 aa  939    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  77.05 
 
 		 489 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  77.31 
 
 		 465 aa  713    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  77.05 
 
 		 473 aa  691    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  68.35 
 
 		 517 aa  631  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  67.9 
 
 		 464 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  42.89 
 
 		 473 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  42.47 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  43.26 
 
 		 466 aa  342  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  40.96 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  39.35 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  39.28 
 
 		 471 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 452 aa  169  7e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  31.07 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 		 470 aa  156  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  31.19 
 
 		 583 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  26.75 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  28.35 
 
 		 483 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.19 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 471 aa  93.6  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  19.61 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  28.65 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 463 aa  67  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.22 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  18.71 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  22.8 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  20.45 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 470 aa  54.7  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.96 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 525 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 1496 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.78 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  25.22 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 451 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 		 427 aa  50.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 		 467 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 435 aa  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  24.35 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.69 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.86 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 485 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.81 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.14 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.14 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.14 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.14 
 
 		 482 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.86 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.14 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  25.12 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  20.89 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>