139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3732 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  67.25 
 
 
230 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  68.75 
 
 
229 aa  308  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  63.48 
 
 
230 aa  307  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  63.04 
 
 
230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  62.61 
 
 
230 aa  305  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  61.3 
 
 
230 aa  298  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  60 
 
 
230 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  60 
 
 
230 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  60 
 
 
230 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  60 
 
 
230 aa  293  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  60 
 
 
230 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  59.13 
 
 
230 aa  277  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  55.22 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  52.94 
 
 
229 aa  244  9e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  43.62 
 
 
229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  41.83 
 
 
219 aa  141  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  36.82 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  37.44 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  37.67 
 
 
241 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  36.18 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  38.02 
 
 
256 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  32.39 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  34.62 
 
 
240 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  35.45 
 
 
231 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  31.78 
 
 
221 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  34.02 
 
 
280 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  35 
 
 
240 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  34.55 
 
 
240 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  33 
 
 
234 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  34.55 
 
 
240 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  34.55 
 
 
240 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  34.2 
 
 
239 aa  101  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  34.53 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  33.63 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  34.08 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  33.03 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  32.91 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  32.77 
 
 
263 aa  95.5  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  33.48 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  33.66 
 
 
272 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  34.42 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  35.75 
 
 
255 aa  89  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  31.34 
 
 
240 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  32.77 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  31.94 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  29.41 
 
 
242 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  31.02 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  35.1 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  33.16 
 
 
266 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  28.06 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  32.31 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  34.29 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  30.73 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  30.32 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  34.02 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  30.7 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  43.43 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  32 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  33.17 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  40 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  28.91 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  36.8 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  32.88 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  32.88 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  39.05 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  31.47 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  32.19 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  31.07 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  30.34 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  37.29 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  42.35 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  40.78 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  39.25 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  36.44 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  30.11 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  34.65 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  42.06 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  33.12 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  31.82 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  30 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  33.82 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  33.17 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  30.43 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  37.4 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  31.89 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  30.13 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  30.35 
 
 
269 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  35.29 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  31.39 
 
 
279 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3246  hypothetical protein  27.62 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.789189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3985  hypothetical protein  32.52 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  27.19 
 
 
265 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  32.81 
 
 
256 aa  62.8  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  31.87 
 
 
238 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  30.81 
 
 
268 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  36.49 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0466  hypothetical protein  41.77 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>