More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3719 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  61.9 
 
 		 547 aa  685    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  59.6 
 
 		 549 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  62.15 
 
 		 540 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  61.51 
 
 		 551 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 538 aa  1099    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  59.93 
 
 		 544 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  59.6 
 
 		 549 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  61.57 
 
 		 551 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  61.32 
 
 		 550 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  63.62 
 
 		 533 aa  697    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  59.23 
 
 		 549 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  59.62 
 
 		 547 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  43.63 
 
 		 534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  43.98 
 
 		 532 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  48.21 
 
 		 563 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  51.28 
 
 		 561 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560.2  small-conductance mechanosensitive channel  54.81 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  87.88 
 
 		 200 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  67.37 
 
 		 292 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  49.82 
 
 		 531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  45.65 
 
 		 494 aa  272  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0522  putative small-conductance mechanosensitive channel  41.09 
 
 		 331 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  44.32 
 
 		 270 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  42.91 
 
 		 276 aa  226  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  41.03 
 
 		 275 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  42.13 
 
 		 275 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  37.45 
 
 		 269 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 		 277 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  39.09 
 
 		 280 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  40.25 
 
 		 279 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  48.28 
 
 		 279 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  37.69 
 
 		 288 aa  204  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  37.27 
 
 		 287 aa  203  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  39.61 
 
 		 267 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  37.64 
 
 		 286 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  45.41 
 
 		 279 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  41.22 
 
 		 283 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  39.69 
 
 		 279 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  37.69 
 
 		 288 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  38.72 
 
 		 275 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  37.59 
 
 		 275 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  43.64 
 
 		 283 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  37.59 
 
 		 275 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  37.59 
 
 		 275 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  39.53 
 
 		 274 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 		 267 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  37.22 
 
 		 275 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  39.59 
 
 		 275 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  37.7 
 
 		 270 aa  194  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  37.23 
 
 		 275 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 267 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  39.57 
 
 		 276 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  37.31 
 
 		 275 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 277 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  37.59 
 
 		 275 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  37.59 
 
 		 275 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 288 aa  191  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 274 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  39.38 
 
 		 276 aa  190  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 275 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  34.77 
 
 		 276 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 		 275 aa  186  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  42.06 
 
 		 280 aa  184  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  37.1 
 
 		 281 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.65 
 
 		 289 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 274 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 274 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 289 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.65 
 
 		 289 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 268 aa  181  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  32.37 
 
 		 291 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 270 aa  180  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  32.37 
 
 		 286 aa  180  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 286 aa  180  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  32.37 
 
 		 286 aa  180  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  32.37 
 
 		 286 aa  180  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  36.72 
 
 		 274 aa  180  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  32.37 
 
 		 286 aa  180  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  32.37 
 
 		 286 aa  180  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  32.37 
 
 		 286 aa  180  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  32.37 
 
 		 286 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 292 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  37.3 
 
 		 271 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  36.7 
 
 		 277 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  37.6 
 
 		 271 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  35.97 
 
 		 274 aa  176  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  37.74 
 
 		 286 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  38.21 
 
 		 286 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  38.21 
 
 		 286 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  38.21 
 
 		 286 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  36.48 
 
 		 268 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  38.21 
 
 		 286 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  34.6 
 
 		 288 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 293 aa  173  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  39.53 
 
 		 298 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 273 aa  170  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 283 aa  170  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  35.63 
 
 		 277 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  33.84 
 
 		 278 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>