49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3714 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  100 
 
 		 263 aa  511  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  79.62 
 
 		 265 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  81.3 
 
 		 286 aa  388  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  75.39 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  75.79 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  74.13 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  75.79 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  73.36 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  73.44 
 
 		 261 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  78.23 
 
 		 266 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  75.86 
 
 		 266 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  78.23 
 
 		 266 aa  357  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  77.82 
 
 		 266 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  74.52 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  74.49 
 
 		 251 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  70.28 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  41.41 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  41 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  47.7 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  32.64 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  35.96 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  37.29 
 
 		 466 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  30.95 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  28.57 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  27.69 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  28.8 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  25.35 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  42.17 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  42.47 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  25.93 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  25.93 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  25.85 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  28.23 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  41.1 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  39.36 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  39.36 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  42.67 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  26.09 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  41.77 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  39.36 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  27.59 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  26.47 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  41.77 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  28.02 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0220  zinc ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 		 125 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  38.3 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  34.74 
 
 		 270 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>