More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3648 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  100 
 
 		 461 aa  967    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  68.83 
 
 		 462 aa  676    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  54.64 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  54.66 
 
 		 476 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  37.39 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  36.74 
 
 		 488 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  31.59 
 
 		 460 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  32.48 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  34.91 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  26.99 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.96 
 
 		 367 aa  124  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  32.33 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  27.2 
 
 		 427 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  26.28 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  26.28 
 
 		 464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  26.28 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  26.28 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  25.43 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  30.54 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  27.34 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  24.24 
 
 		 422 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  31.22 
 
 		 388 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  27.22 
 
 		 381 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  26.03 
 
 		 385 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  27.9 
 
 		 372 aa  116  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  26.01 
 
 		 404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.53 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  30.13 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  21.55 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  20.92 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  27.62 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  29.5 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  28.75 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  23.01 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  29.71 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  27.23 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  26.7 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  27.19 
 
 		 287 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  29.8 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  26.85 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  24.38 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  24.28 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  28.98 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.69 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  24.28 
 
 		 387 aa  97.8  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  26.39 
 
 		 392 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  24.79 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  29.66 
 
 		 401 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.42 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  26.01 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  22.66 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  25.28 
 
 		 382 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  26.1 
 
 		 394 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.88 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  24.02 
 
 		 445 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  25.42 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  26.32 
 
 		 394 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  29.67 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  27.31 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  24.57 
 
 		 380 aa  91.3  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  26.16 
 
 		 384 aa  90.9  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  26.89 
 
 		 391 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.47 
 
 		 414 aa  90.1  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  24.26 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  25.7 
 
 		 380 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  24.71 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  24.26 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  24.88 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  24.94 
 
 		 388 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.52 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  26.84 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  26.03 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.74 
 
 		 412 aa  87.4  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  27.19 
 
 		 391 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  26.86 
 
 		 393 aa  87  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  28.83 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  28.83 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  28.83 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  30.29 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  30.29 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  30.29 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.03 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.73 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.7 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  24.5 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  24.89 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  27.17 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  24.08 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.73 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.47 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.73 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.73 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.15 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  22.51 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.44 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.02 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.73 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.15 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  25.15 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.15 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>