25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3593 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3593  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  118  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.73085e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4220  hypothetical protein  85.48 
 
 
62 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.95961e-07  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0749  hypothetical protein  89.29 
 
 
56 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  9.84241e-09  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3292  hypothetical protein  77.42 
 
 
62 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.41896e-07  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  70.97 
 
 
90 aa  98.2  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.52311e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  69.35 
 
 
66 aa  97.1  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.97115e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  69.35 
 
 
62 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.44009e-07  hitchhiker  3.21766e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  69.35 
 
 
62 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  2.82056e-06  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  67.74 
 
 
62 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  69.35 
 
 
62 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.19978e-07  hitchhiker  3.01023e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  66.13 
 
 
62 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0734  hypothetical protein  62.9 
 
 
64 aa  83.2  1e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.969e-05  hitchhiker  0.0032638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0704  hypothetical protein  62.9 
 
 
69 aa  82.8  1e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.86245e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3650  hypothetical protein  61.29 
 
 
62 aa  82.4  2e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.59809e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0725  hypothetical protein  61.29 
 
 
62 aa  79.7  1e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541071  hitchhiker  2.73453e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  55.93 
 
 
60 aa  67  8e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  62.4  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  50.85 
 
 
61 aa  61.2  4e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  50.98 
 
 
61 aa  58.2  4e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  42.37 
 
 
68 aa  53.9  6e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  43.4 
 
 
61 aa  51.6  3e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  48.08 
 
 
66 aa  51.6  4e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  33.87 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  43.9 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  47.5 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>