130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3591 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3591  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.55002e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0751  Sel1 domain-containing protein  74.4 
 
 
227 aa  345  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.8908e-06  hitchhiker  0.00284234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3290  Sel1 domain-containing protein  81.38 
 
 
228 aa  338  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000129217  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  68.93 
 
 
218 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.02064e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  68.93 
 
 
218 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  68.93 
 
 
218 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  68.93 
 
 
218 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  9.77989e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  67.48 
 
 
218 aa  306  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.06188e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  73.51 
 
 
220 aa  305  2e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  65.05 
 
 
206 aa  296  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  64.56 
 
 
218 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  64.56 
 
 
218 aa  295  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  64.56 
 
 
218 aa  295  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.2376e-05  hitchhiker  9.18521e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  64.77 
 
 
213 aa  280  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  59.61 
 
 
204 aa  264  9e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  63.04 
 
 
205 aa  256  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  47.78 
 
 
232 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03473  sodium-type flagellar motor component  47.22 
 
 
214 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4618  sodium-type flagellar protein MotX  39.32 
 
 
211 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  39.22 
 
 
210 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  38.24 
 
 
211 aa  148  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  36.55 
 
 
211 aa  148  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  40.11 
 
 
211 aa  147  1e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.73255e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  33.04 
 
 
831 aa  57.8  1e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  34.69 
 
 
258 aa  54.3  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 
258 aa  53.9  1e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.48 
 
 
222 aa  54.3  1e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.8 
 
 
685 aa  54.3  1e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  34.69 
 
 
258 aa  54.7  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  34.69 
 
 
255 aa  53.5  2e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  33.03 
 
 
258 aa  53.9  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  31.19 
 
 
258 aa  52.4  4e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  32.11 
 
 
250 aa  52.4  5e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  31.19 
 
 
260 aa  52.4  5e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  32.11 
 
 
257 aa  52  7e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  31.19 
 
 
250 aa  52  7e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  31.19 
 
 
250 aa  52  7e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30 
 
 
789 aa  51.6  9e-06  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
1032 aa  50.8  1e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  28.87 
 
 
393 aa  50.8  1e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.64549e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  33.67 
 
 
258 aa  50.8  2e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  33.67 
 
 
258 aa  50.8  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.12 
 
 
2413 aa  50.4  2e-05  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  33.67 
 
 
258 aa  50.8  2e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  33.67 
 
 
258 aa  50.8  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 
1430 aa  49.7  3e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  32.65 
 
 
236 aa  49.7  3e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
478 aa  49.3  4e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 
234 aa  49.3  4e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  29.17 
 
 
218 aa  49.3  4e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  30.51 
 
 
260 aa  48.9  5e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.57 
 
 
1037 aa  48.9  5e-05  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.03 
 
 
241 aa  49.3  5e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  32.61 
 
 
693 aa  48.1  8e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  30.3 
 
 
961 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 
343 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.4 
 
 
325 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.63 
 
 
234 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.77 
 
 
373 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  25.93 
 
 
1402 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.24156e-07 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  31.4 
 
 
325 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.23 
 
 
961 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.08 
 
 
489 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  24.77 
 
 
523 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.26 
 
 
1002 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  31.63 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0241  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
480 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.381439  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.46 
 
 
342 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  38.03 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.67 
 
 
373 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  29.63 
 
 
416 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
303 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.47126e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  30.95 
 
 
307 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.35758e-05  unclonable  1.52447e-07 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
664 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  26.32 
 
 
410 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  26.62 
 
 
971 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.62 
 
 
971 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1107  hypothetical protein  28.03 
 
 
935 aa  45.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.489454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  27.71 
 
 
254 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
976 aa  45.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  32.94 
 
 
358 aa  45.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.89 
 
 
1493 aa  45.1  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.25 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.23 
 
 
318 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  26.67 
 
 
684 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  30.23 
 
 
285 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  31.65 
 
 
254 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.26 
 
 
838 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  24.74 
 
 
765 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.91 
 
 
490 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
448 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  28.04 
 
 
415 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  27.84 
 
 
680 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  27.91 
 
 
490 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  29.67 
 
 
271 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  24.24 
 
 
315 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  26.8 
 
 
679 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>