62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3582 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  48.12 
 
 
718 aa  694  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  48.18 
 
 
718 aa  695  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  76.45 
 
 
732 aa  1192  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  47.58 
 
 
718 aa  694  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  76.58 
 
 
732 aa  1192  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  6.01769e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  83.45 
 
 
734 aa  1299  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  4.14607e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  47.93 
 
 
718 aa  681  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  76.45 
 
 
732 aa  1196  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  47.64 
 
 
718 aa  687  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  48.12 
 
 
718 aa  695  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  81.05 
 
 
740 aa  1255  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.33423e-05  hitchhiker  7.33664e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  76.31 
 
 
732 aa  1192  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  3.53181e-09 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  46.63 
 
 
721 aa  665  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  80.38 
 
 
739 aa  1253  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.22811e-05  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  47.79 
 
 
718 aa  698  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  3.20991e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  76.18 
 
 
732 aa  1188  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  100 
 
 
743 aa  1541  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.36948e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  46.33 
 
 
718 aa  681  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  47.11 
 
 
718 aa  690  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  73.22 
 
 
729 aa  1122  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  9.42986e-05  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  48.41 
 
 
738 aa  683  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  47.07 
 
 
718 aa  690  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  73.89 
 
 
731 aa  1143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  77.12 
 
 
732 aa  1199  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  47.07 
 
 
718 aa  691  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  77.39 
 
 
732 aa  1201  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  77.66 
 
 
732 aa  1204  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  9.35307e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  47.01 
 
 
718 aa  688  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  47.07 
 
 
718 aa  691  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  47.23 
 
 
718 aa  670  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  70.89 
 
 
941 aa  1097  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  76.99 
 
 
732 aa  1197  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  4.0961e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  46.27 
 
 
718 aa  676  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  44.05 
 
 
731 aa  631  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  42.61 
 
 
716 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  42.8 
 
 
716 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  2.05718e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  43.82 
 
 
707 aa  594  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  44.3 
 
 
720 aa  591  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  38.85 
 
 
732 aa  494  1e-138  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  39.78 
 
 
715 aa  494  1e-138  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  38.04 
 
 
767 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  35.06 
 
 
786 aa  400  1e-110  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  33.86 
 
 
725 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  31.93 
 
 
704 aa  331  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  30.5 
 
 
722 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  31.2 
 
 
714 aa  320  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  31.13 
 
 
714 aa  313  8e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  31.05 
 
 
718 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  29.8 
 
 
721 aa  287  5e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  28.34 
 
 
720 aa  276  9e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  28.44 
 
 
701 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  27.87 
 
 
706 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  28.18 
 
 
714 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  27.52 
 
 
706 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  27.25 
 
 
706 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  28.71 
 
 
751 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  36.16 
 
 
712 aa  204  7e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  27.82 
 
 
688 aa  200  8e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  26.49 
 
 
710 aa  180  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  27.23 
 
 
711 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  26.77 
 
 
759 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  30.27 
 
 
713 aa  147  7e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>