More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3581 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  74.84 
 
 
471 aa  710  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  89.96 
 
 
468 aa  874  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.59812e-08  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  91.24 
 
 
468 aa  884  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.07977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  71.02 
 
 
478 aa  682  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  6.86038e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  73.54 
 
 
471 aa  702  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  72.22 
 
 
468 aa  711  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.721e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0550  replicative DNA helicase  70.51 
 
 
470 aa  650  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  74.84 
 
 
471 aa  710  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  88.89 
 
 
468 aa  865  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.37695e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  72.22 
 
 
468 aa  707  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  73.54 
 
 
471 aa  702  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  72.86 
 
 
467 aa  709  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  74.18 
 
 
466 aa  695  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  73.93 
 
 
468 aa  725  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  73.32 
 
 
471 aa  702  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  73.54 
 
 
471 aa  702  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  89.96 
 
 
468 aa  874  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.2144e-05  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  88.03 
 
 
468 aa  860  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  91.24 
 
 
468 aa  884  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.32195e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  93.59 
 
 
468 aa  904  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.42812e-07  unclonable  2.95185e-06 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  72.02 
 
 
465 aa  703  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  73.75 
 
 
471 aa  704  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  74.84 
 
 
471 aa  710  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  91.24 
 
 
468 aa  884  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  3.88708e-12 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  71.91 
 
 
470 aa  701  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  69.51 
 
 
466 aa  658  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  74.84 
 
 
471 aa  710  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  87.61 
 
 
468 aa  834  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  89.74 
 
 
468 aa  871  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.29174e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  89.32 
 
 
468 aa  870  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.91308e-06  hitchhiker  8.17807e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  74.84 
 
 
471 aa  710  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  73.08 
 
 
468 aa  719  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.57541e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  73.54 
 
 
471 aa  702  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  94.02 
 
 
468 aa  900  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.11425e-05  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  73.87 
 
 
474 aa  716  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  92.95 
 
 
468 aa  893  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.07576e-05  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  91.24 
 
 
468 aa  884  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.04004e-06  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  72.37 
 
 
472 aa  702  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  74.15 
 
 
468 aa  726  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  72.22 
 
 
468 aa  711  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  9.03078e-11  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  73.54 
 
 
471 aa  702  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  73.84 
 
 
451 aa  702  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.04415e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  74.18 
 
 
466 aa  716  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.92135e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  73.32 
 
 
471 aa  701  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  90.17 
 
 
468 aa  875  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  100 
 
 
468 aa  955  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.1661e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  73.54 
 
 
471 aa  702  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  62.2 
 
 
472 aa  595  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  62.83 
 
 
464 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  62.61 
 
 
464 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  61.71 
 
 
464 aa  575  1e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  60.44 
 
 
465 aa  574  1e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  60.66 
 
 
465 aa  574  1e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  60.66 
 
 
465 aa  574  1e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.80092e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  60.22 
 
 
465 aa  573  1e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  61.54 
 
 
465 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  60.22 
 
 
464 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  60.22 
 
 
465 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  60 
 
 
464 aa  564  1e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  59.78 
 
 
460 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  59.55 
 
 
460 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  60 
 
 
463 aa  561  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  60.45 
 
 
461 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  59.47 
 
 
462 aa  555  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  59.28 
 
 
458 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03768  replicative DNA helicase  67.02 
 
 
384 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.40287e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  58.97 
 
 
461 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  57.37 
 
 
472 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  58.94 
 
 
463 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  58.5 
 
 
463 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  57.92 
 
 
457 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  57.92 
 
 
457 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  56.22 
 
 
472 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  57.84 
 
 
462 aa  517  1e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
460 aa  515  1e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
460 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
460 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
460 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
460 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  57.05 
 
 
460 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
460 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  57.05 
 
 
460 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  57.62 
 
 
461 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
460 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  57.05 
 
 
460 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
460 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  57.27 
 
 
460 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  57.62 
 
 
461 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  57.27 
 
 
460 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  54.35 
 
 
462 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  56.76 
 
 
462 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  56.18 
 
 
470 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  56.76 
 
 
462 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  57.05 
 
 
460 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  56.64 
 
 
473 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  56.67 
 
 
470 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  2.53139e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  55.56 
 
 
463 aa  492  1e-138  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  54.34 
 
 
488 aa  485  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  53.8 
 
 
469 aa  481  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  51.33 
 
 
472 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>