More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3574 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  70 
 
 		 582 aa  841    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  100 
 
 		 586 aa  1189    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  69.66 
 
 		 582 aa  813    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  69.66 
 
 		 582 aa  813    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  70.34 
 
 		 582 aa  846    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  70.34 
 
 		 582 aa  826    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  58.65 
 
 		 584 aa  696    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  92.49 
 
 		 586 aa  1099    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  49.18 
 
 		 609 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  45.78 
 
 		 599 aa  499  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  44.23 
 
 		 603 aa  419  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  44.67 
 
 		 591 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  42.36 
 
 		 606 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  40.79 
 
 		 605 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  39.18 
 
 		 597 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  42.11 
 
 		 598 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.55 
 
 		 502 aa  300  4e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 608 aa  299  9e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  36.55 
 
 		 925 aa  290  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  36.41 
 
 		 925 aa  289  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  35.15 
 
 		 650 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  35.82 
 
 		 957 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.42 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  37.48 
 
 		 515 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  39.51 
 
 		 464 aa  277  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  38.58 
 
 		 598 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.01 
 
 		 593 aa  276  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  32.32 
 
 		 926 aa  276  8e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  38.58 
 
 		 598 aa  276  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  37.28 
 
 		 515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  39.08 
 
 		 596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  39.3 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  39.3 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  39.3 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  37.12 
 
 		 517 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  39.3 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  39.14 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  38.38 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  39.32 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  42.6 
 
 		 591 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  40.6 
 
 		 589 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.59 
 
 		 596 aa  273  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  36.67 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.98 
 
 		 596 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  36.17 
 
 		 589 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  39.82 
 
 		 596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  37.98 
 
 		 597 aa  270  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  35.11 
 
 		 637 aa  270  8e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  37.33 
 
 		 596 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  39.05 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  38.79 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.17 
 
 		 1005 aa  267  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  35.39 
 
 		 510 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  38.06 
 
 		 596 aa  260  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  31.77 
 
 		 1004 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  35.91 
 
 		 483 aa  257  5e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  34.74 
 
 		 616 aa  256  7e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  33.28 
 
 		 631 aa  256  9e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.33 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 589 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.04 
 
 		 465 aa  249  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.16 
 
 		 515 aa  246  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.76 
 
 		 519 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  33.82 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  33.54 
 
 		 517 aa  240  5e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  34.39 
 
 		 519 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.6 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  32.3 
 
 		 519 aa  234  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  32.91 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  33.55 
 
 		 521 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  32.98 
 
 		 511 aa  223  7e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  32.86 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  32.99 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  32.79 
 
 		 506 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  32.7 
 
 		 506 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  31.56 
 
 		 506 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.4 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  32.5 
 
 		 518 aa  209  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  32.51 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  31.14 
 
 		 511 aa  207  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  31.72 
 
 		 506 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  32.09 
 
 		 506 aa  204  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  33.95 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  30.86 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  32.86 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  33.05 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  33.05 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  29.91 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  31.63 
 
 		 507 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  30.84 
 
 		 635 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  30.44 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  31.47 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  30.93 
 
 		 506 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  30.26 
 
 		 494 aa  187  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.85 
 
 		 506 aa  186  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  30.19 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  31.63 
 
 		 506 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  29.84 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>