30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3564 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  72.24 
 
 
245 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  72.24 
 
 
245 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  71.84 
 
 
245 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  73.02 
 
 
252 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  71.83 
 
 
249 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  71.26 
 
 
254 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  0.0000000000796342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  72.73 
 
 
231 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000415651  hitchhiker  0.000000000063684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  69.26 
 
 
231 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  70.56 
 
 
231 aa  355  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  70.13 
 
 
231 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  70.13 
 
 
231 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  68.12 
 
 
231 aa  344  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  63.67 
 
 
244 aa  328  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  61.38 
 
 
246 aa  289  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  53.47 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  37.3 
 
 
251 aa  165  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  36.6 
 
 
238 aa  151  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  32.41 
 
 
252 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  31.95 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  26.72 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  28.86 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  24.31 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  26.04 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  24.54 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  23.39 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  30.22 
 
 
199 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  25.55 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2792  hypothetical protein  21.88 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1874  hypothetical protein  29.25 
 
 
227 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>