More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3531 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 678 aa  1397    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.88 
 
 		 653 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.82 
 
 		 675 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 651 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 669 aa  182  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 685 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 665 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 654 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 674 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 683 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 716 aa  159  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 675 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 708 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  24.44 
 
 		 682 aa  155  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 668 aa  150  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 731 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 731 aa  146  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 656 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 656 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 697 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  22.95 
 
 		 677 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 663 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 649 aa  138  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 650 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 744 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 667 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 693 aa  124  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 657 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  30.91 
 
 		 741 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  30.91 
 
 		 729 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 728 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  30.74 
 
 		 707 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 737 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 749 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 767 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 695 aa  111  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  20.32 
 
 		 727 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 735 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 718 aa  100  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 647 aa  99  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 676 aa  98.6  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 699 aa  99  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 653 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 653 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 653 aa  97.4  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.79 
 
 		 653 aa  95.5  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 652 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  22.88 
 
 		 636 aa  94.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 653 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 627 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 653 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 653 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 634 aa  91.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  21.61 
 
 		 662 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 605 aa  90.9  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  33.14 
 
 		 611 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 653 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  41.75 
 
 		 677 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  33.69 
 
 		 661 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  38.36 
 
 		 681 aa  88.6  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 751 aa  87.8  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 699 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 648 aa  87  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.2 
 
 		 693 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 634 aa  86.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  32.55 
 
 		 646 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 688 aa  84.7  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 709 aa  84  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 657 aa  84  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.68 
 
 		 647 aa  83.2  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 617 aa  82  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 713 aa  81.3  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 627 aa  81.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 659 aa  80.9  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 698 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 		 707 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  38.93 
 
 		 710 aa  80.9  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 611 aa  80.9  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 679 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  31.72 
 
 		 617 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.43 
 
 		 623 aa  80.1  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 656 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  35.54 
 
 		 718 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  29.71 
 
 		 633 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 769 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  35.86 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  34.3 
 
 		 618 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 697 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  32.93 
 
 		 618 aa  77.8  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 616 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.75 
 
 		 1023 aa  78.2  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 705 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 615 aa  77.4  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.95 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 703 aa  77.4  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 797 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  29.19 
 
 		 704 aa  77.4  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  29.7 
 
 		 650 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>