60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3500 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3500  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3116  hypothetical protein  78.79 
 
 		 67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0900  hypothetical protein  78.79 
 
 		 67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0888  hypothetical protein  78.79 
 
 		 67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0864  hypothetical protein  78.79 
 
 		 67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3475  hypothetical protein  78.79 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0742  hypothetical protein  81.54 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3280  hypothetical protein  81.54 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3392  hypothetical protein  81.54 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0886  hypothetical protein  81.54 
 
 		 66 aa  111  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3177  hypothetical protein  77.78 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2995  hypothetical protein  80.33 
 
 		 65 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3283  hypothetical protein  76.19 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0594  hypothetical protein  77.42 
 
 		 66 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.203773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3860  hypothetical protein  74.19 
 
 		 66 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0679  hypothetical protein  69.35 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03981  predicted nucleic-acid-binding protein containing an-ribbon domain  52.24 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.978441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0111  hypothetical protein  46.27 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3767  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103883  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3546  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3819  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000754125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0363  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.049912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3631  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000471494  hitchhiker  0.000413394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0363  conserved hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869191  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3724  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000786305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4659  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329375  normal  0.021079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03152  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000462043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3929  hypothetical protein  43.84 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0358004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3686  hypothetical protein  43.84 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.88375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0267  hypothetical protein  43.84 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.412857  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0434  hypothetical protein  53.03 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00067  hypothetical protein  45.59 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4559  hypothetical protein  44.44 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0405858  normal  0.361912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3726  hypothetical protein  40.62 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0444332  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3761  hypothetical protein  40.62 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0464102  normal  0.29121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3652  hypothetical protein  40.62 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00259735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3653  hypothetical protein  40.62 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3824  hypothetical protein  40.62 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.043094  normal  0.823477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002287  hypothetical protein  43.08 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.469964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2183  hypothetical protein  43.08 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000451825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0301  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3198  hypothetical protein  46.15 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426045  normal  0.0272863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0302  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.691843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0378  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0398  hypothetical protein  56.41 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3844  hypothetical protein  45.31 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0143  hypothetical protein  38.18 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0097  hypothetical protein  34.92 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0112  hypothetical protein  34.92 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0046  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0032  hypothetical protein  38.1 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0112  nucleic acid binding protein  33.33 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0089  hypothetical protein  38.3 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4024  hypothetical protein  40.62 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00800  hypothetical protein  45.95 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0068  hypothetical protein  45.95 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4462  nucleic acid binding protein  40 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01080  hypothetical protein  35.9 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2241  hypothetical protein  30.77 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>