28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3463 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  100 
 
 		 680 aa  1419    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  100 
 
 		 680 aa  1419    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  24.17 
 
 		 688 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 600 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 600 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  24.02 
 
 		 707 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.4 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.28 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  22.63 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2364  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.55 
 
 		 729 aa  63.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.41 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.35 
 
 		 650 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  21.89 
 
 		 683 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  21.89 
 
 		 683 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  21.13 
 
 		 533 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  27.81 
 
 		 289 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03073  hypothetical protein  25.51 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1212  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 392 aa  50.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  21.69 
 
 		 682 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7605  hypothetical protein  25.32 
 
 		 631 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  23.28 
 
 		 236 aa  45.8  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 624 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 624 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 624 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  25.39 
 
 		 624 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  25.39 
 
 		 624 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  25.39 
 
 		 624 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 694 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>