More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3442 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 337 aa  691    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0795  glycosyl transferase group 1  44.79 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3788  glycosyltransferase  46.44 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  32.92 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 739 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  43.48 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 750 aa  76.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  40.15 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4987  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1085  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  42.2 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.57 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  32.18 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0539  starch synthase  37.04 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1380  starch synthase  36.11 
 
 		 523 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0651235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 387 aa  67  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  35.29 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  39.64 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 		 410 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  40.37 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 410 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  29.24 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  33.77 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  37.84 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0299  starch synthase  35.19 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  28.26 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  39.82 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.94 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0498  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  21.41 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0148248  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1308  starch synthase  34.25 
 
 		 482 aa  66.2  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483213  normal  0.910545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  40.68 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.93 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 		 1080 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  28.24 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.17 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  42.34 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2188  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.777169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0297  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.6 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  28.44 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>