44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3433 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 292 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  40.62 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  38.34 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  38.39 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  39.73 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  38.76 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  37.62 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  39.84 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  38.76 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  38.76 
 
 		 315 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  40.25 
 
 		 217 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  31.03 
 
 		 198 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  35.67 
 
 		 195 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  34.09 
 
 		 201 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  29.89 
 
 		 198 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 198 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  32.9 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  33.92 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  32.46 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  32.2 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  31.25 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  30.99 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  30.25 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  30.77 
 
 		 894 aa  63.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  26.42 
 
 		 389 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  30 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  23.89 
 
 		 409 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  31.94 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  22.35 
 
 		 382 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1994  ribonuclease D  29.83 
 
 		 373 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  23.91 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  29.27 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  28.89 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  26.47 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  31.86 
 
 		 381 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  25 
 
 		 399 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  25.7 
 
 		 393 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  26.26 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  25 
 
 		 381 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  34.38 
 
 		 403 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  25.41 
 
 		 389 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  25 
 
 		 385 aa  42.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  22.41 
 
 		 384 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30755  predicted protein  26.99 
 
 		 497 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>