More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3382 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  100 
 
 		 308 aa  634    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  73.44 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  69.34 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  63.73 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  67.15 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  68.6 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  67.42 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  67.42 
 
 		 321 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  66.29 
 
 		 269 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  65.57 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  63.5 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  63.5 
 
 		 297 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  66.8 
 
 		 297 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  63.5 
 
 		 297 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  61.62 
 
 		 307 aa  348  6e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.09 
 
 		 271 aa  308  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  48.61 
 
 		 280 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  45.06 
 
 		 261 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  45.06 
 
 		 261 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  44.7 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  45.06 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  47.45 
 
 		 262 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  45.2 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 295 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  45 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  45.02 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  44.18 
 
 		 255 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  46.4 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.4 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 275 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  42.01 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.32 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  42.97 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.08 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  41.18 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  40.08 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  41.67 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  41.43 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  40.65 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 		 257 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  42.23 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  40 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  40.78 
 
 		 257 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  40 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  39.76 
 
 		 259 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  43.01 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  39.6 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  40.8 
 
 		 257 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  44.07 
 
 		 384 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  44 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  41.73 
 
 		 265 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  41.35 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  44.17 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.43 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.98 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  41 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.98 
 
 		 257 aa  189  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  40.48 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 536 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  38.82 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  41 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  37.89 
 
 		 490 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  35.97 
 
 		 424 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  35.58 
 
 		 409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.86 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.1 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  40.16 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.26 
 
 		 265 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  36.26 
 
 		 265 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  39.32 
 
 		 266 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.26 
 
 		 265 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  36.26 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.26 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.26 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  36.26 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.26 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.66 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.64 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.26 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  38.71 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  39.76 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.07 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 		 263 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 		 418 aa  178  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4124  ABC transporter related  37.35 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  36.89 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.38 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>